More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1939 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 552 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  56.22 
 
 		 550 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  54.25 
 
 		 545 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  46.71 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  46.71 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  44.98 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  46.71 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  44.83 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  44.98 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  43.44 
 
 		 503 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  45.3 
 
 		 503 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  45.38 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  45.36 
 
 		 502 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  43.79 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  45.06 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  41.65 
 
 		 503 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  41.85 
 
 		 503 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  41.27 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  41.62 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  39.48 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  39.6 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  39.73 
 
 		 515 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  39.66 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  39.68 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  41.3 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  41.46 
 
 		 512 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  40.76 
 
 		 492 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  39.06 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  38.7 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  39.57 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  41.68 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  39.02 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  43.56 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  42.63 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  40.4 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  40.6 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  42.41 
 
 		 512 aa  329  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  37.25 
 
 		 521 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 495 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  37.11 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  41.1 
 
 		 517 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  36.87 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  38.55 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  38.79 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 		 503 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  36.29 
 
 		 503 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  36.78 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  38.63 
 
 		 498 aa  317  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  38.51 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  36.79 
 
 		 490 aa  312  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  38.09 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  37.5 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  36.08 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  38.55 
 
 		 509 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  36.63 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  38.13 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  36.09 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  35.43 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  35.63 
 
 		 489 aa  297  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  36.4 
 
 		 665 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  35.5 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  40.08 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  39.62 
 
 		 499 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  39.24 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  41.55 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.86 
 
 		 500 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.08 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.56 
 
 		 540 aa  224  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  32.04 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  29.46 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  29.46 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  30.3 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  31.68 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  24.77 
 
 		 545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  29.11 
 
 		 540 aa  127  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.54 
 
 		 731 aa  126  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.32 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.5 
 
 		 731 aa  125  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.8 
 
 		 731 aa  124  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.09 
 
 		 737 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.4 
 
 		 736 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.16 
 
 		 721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.59 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.28 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  28.16 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.45 
 
 		 737 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.93 
 
 		 736 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.91 
 
 		 759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  30.71 
 
 		 754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.82 
 
 		 763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.9 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 		 738 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.08 
 
 		 732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  34.35 
 
 		 718 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>