More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1288 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  85.66 
 
 
488 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  95.49 
 
 
488 aa  943    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  100 
 
 
488 aa  979    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  95.49 
 
 
488 aa  944    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  60.86 
 
 
492 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  59.22 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  59.43 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  59 
 
 
496 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  58.35 
 
 
496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  57.2 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  46.28 
 
 
504 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  46.28 
 
 
504 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  46.22 
 
 
504 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  45.4 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  46.84 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  46.69 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  45.45 
 
 
503 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  44.42 
 
 
503 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  42.08 
 
 
512 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  41.88 
 
 
512 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  41.88 
 
 
512 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  42.69 
 
 
537 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  42.22 
 
 
515 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  42.62 
 
 
553 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.85 
 
 
506 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  40.94 
 
 
503 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  41.26 
 
 
512 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 
503 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 
503 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  40.25 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.92 
 
 
502 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  41.79 
 
 
503 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  37.88 
 
 
550 aa  336  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  39.02 
 
 
552 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  39.17 
 
 
512 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  39.04 
 
 
512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  39.96 
 
 
510 aa  329  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  39.72 
 
 
545 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  38.69 
 
 
517 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  35.61 
 
 
492 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  36.46 
 
 
490 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  35.31 
 
 
665 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  34.65 
 
 
495 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  36.42 
 
 
516 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  36.42 
 
 
503 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  36.64 
 
 
521 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  36.64 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  36.23 
 
 
519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  36.22 
 
 
503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 
493 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  34.89 
 
 
497 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 
503 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  34.78 
 
 
493 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  36.64 
 
 
495 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  38.82 
 
 
499 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  34.1 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  34.76 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  38.57 
 
 
499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  34.34 
 
 
494 aa  273  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
489 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  35.07 
 
 
498 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  32.51 
 
 
495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  33.94 
 
 
489 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  32.85 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
489 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 
491 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 
500 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  31.77 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 
499 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  31.84 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  29.61 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  31.05 
 
 
534 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  27.79 
 
 
501 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  34.22 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  36.84 
 
 
545 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  29.06 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  35.25 
 
 
538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  40.34 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  35.25 
 
 
538 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  35.15 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  36.92 
 
 
810 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  39.34 
 
 
637 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  39.34 
 
 
637 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  38.81 
 
 
628 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.96 
 
 
731 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.27 
 
 
731 aa  126  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  35.06 
 
 
620 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  38.86 
 
 
637 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.45 
 
 
732 aa  126  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  39.07 
 
 
637 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.91 
 
 
731 aa  126  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.5 
 
 
731 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.57 
 
 
775 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  34.38 
 
 
829 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  38.21 
 
 
632 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  27.23 
 
 
567 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>