More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3019 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  94.55 
 
 		 495 aa  942    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  73.64 
 
 		 491 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  86.88 
 
 		 503 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  86.88 
 
 		 503 aa  897    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  86.88 
 
 		 503 aa  901    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  86.88 
 
 		 516 aa  900    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  75.76 
 
 		 489 aa  785    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  75.1 
 
 		 489 aa  783    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1074    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  98.38 
 
 		 495 aa  1001    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  96.92 
 
 		 519 aa  1038    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  76.92 
 
 		 490 aa  806    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  75.76 
 
 		 489 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  50.71 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  52.82 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  49.5 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  49.19 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  49.3 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  44.18 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  46.2 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  39.45 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.43 
 
 		 503 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  39.45 
 
 		 512 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  39.84 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38.62 
 
 		 503 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  38.79 
 
 		 506 aa  339  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  38.21 
 
 		 503 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  38.21 
 
 		 503 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  39.14 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  38.81 
 
 		 502 aa  327  5e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 504 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  37.25 
 
 		 552 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.7 
 
 		 550 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  37.42 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 		 504 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  36.98 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  37.17 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  37.17 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  38.05 
 
 		 515 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  36.94 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  37.3 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  36.08 
 
 		 503 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  35.7 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  38.37 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  36.64 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  36.84 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  36.64 
 
 		 488 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  36.64 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  35.17 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  34.87 
 
 		 495 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  35.14 
 
 		 509 aa  281  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  36.92 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  35.79 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  35.58 
 
 		 492 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  36.97 
 
 		 501 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  35.63 
 
 		 492 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.83 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  34.76 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  36.53 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 665 aa  266  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  33.2 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  32.55 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  34.51 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.44 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  33.92 
 
 		 517 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.73 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  32.63 
 
 		 540 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  34.1 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  34.02 
 
 		 499 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  34.02 
 
 		 499 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  29.44 
 
 		 501 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.44 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  27.64 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  38.27 
 
 		 548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  34.17 
 
 		 545 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.48 
 
 		 732 aa  124  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.59 
 
 		 757 aa  120  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  33.45 
 
 		 673 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.46 
 
 		 800 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.49 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.78 
 
 		 763 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.17 
 
 		 718 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.57 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.5 
 
 		 754 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.3 
 
 		 639 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.68 
 
 		 731 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.4 
 
 		 731 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.96 
 
 		 713 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.6 
 
 		 754 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.43 
 
 		 701 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 		 731 aa  114  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.29 
 
 		 810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  28.48 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  32.11 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  27.75 
 
 		 739 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.95 
 
 		 754 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 776 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>