More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2260 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  96.29 
 
 
512 aa  1011    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  93.33 
 
 
510 aa  982    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  84.96 
 
 
517 aa  892    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
512 aa  1046    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  46.23 
 
 
512 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  41.18 
 
 
503 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.61 
 
 
506 aa  352  5.9999999999999994e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  40.82 
 
 
502 aa  351  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  40.83 
 
 
503 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  42.2 
 
 
512 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  39.81 
 
 
499 aa  349  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  42.2 
 
 
512 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  43.81 
 
 
515 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  42 
 
 
512 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  40.86 
 
 
537 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  39.84 
 
 
507 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  40.2 
 
 
503 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 
504 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 
504 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  39.34 
 
 
504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  40.12 
 
 
503 aa  339  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  39.18 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  39.18 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
504 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  39.17 
 
 
488 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  39.53 
 
 
492 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  39.33 
 
 
492 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  39.17 
 
 
488 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  42.79 
 
 
492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  39.56 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 
553 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  38.17 
 
 
488 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  42.63 
 
 
552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  39.51 
 
 
503 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  44.14 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  41.15 
 
 
496 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  43.47 
 
 
496 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  43.38 
 
 
496 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  39.09 
 
 
550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  43.65 
 
 
545 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  34.6 
 
 
497 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  34.68 
 
 
493 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  35.96 
 
 
493 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  35.61 
 
 
493 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 
519 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.94 
 
 
498 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  38.97 
 
 
509 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  38.21 
 
 
665 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  34.62 
 
 
495 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  33.84 
 
 
503 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  33.84 
 
 
516 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  33.69 
 
 
503 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 
521 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  34.05 
 
 
503 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  35.62 
 
 
495 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  34.42 
 
 
492 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  33.26 
 
 
490 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  33.55 
 
 
495 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  41.3 
 
 
499 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  40.72 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  40.82 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 
489 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  35.7 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  32.03 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  34 
 
 
489 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  35.55 
 
 
495 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  35.62 
 
 
494 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.81 
 
 
491 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.87 
 
 
540 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.07 
 
 
500 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  38.25 
 
 
517 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  34.41 
 
 
499 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  30.58 
 
 
501 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.2 
 
 
492 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  30.73 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  33.45 
 
 
548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 
471 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  29.47 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  29.47 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  32.09 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  36.71 
 
 
775 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.77 
 
 
731 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.4 
 
 
731 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.62 
 
 
731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  32.3 
 
 
538 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  32.3 
 
 
538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.94 
 
 
731 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.81 
 
 
732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.93 
 
 
738 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.21 
 
 
768 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  31.58 
 
 
829 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.07 
 
 
736 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.41 
 
 
718 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.2 
 
 
737 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1085  cell division protein FtsH, putative  32.07 
 
 
538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.86 
 
 
737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.84 
 
 
715 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  34.75 
 
 
732 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.35 
 
 
753 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.81 
 
 
760 aa  119  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>