More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0681 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  100 
 
 		 495 aa  1024    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  55.58 
 
 		 491 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  54.05 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  54.05 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  41.52 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  40.2 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  40.2 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  41.29 
 
 		 502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  41.14 
 
 		 503 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  40.28 
 
 		 504 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 503 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  40.4 
 
 		 512 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  40.16 
 
 		 512 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  40.04 
 
 		 503 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  38.62 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  37.7 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  37.11 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  38.57 
 
 		 503 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  38 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  38 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  38.09 
 
 		 507 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  38.57 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  37.94 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  37.88 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  37.9 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  37.24 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  37.09 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 		 550 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  41.31 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  35.57 
 
 		 492 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  36.59 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  36.57 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  34.85 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  36.02 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  36.02 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  37.27 
 
 		 492 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  35.88 
 
 		 503 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  35.64 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  34.65 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  35.28 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  34.65 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  34.48 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.11 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  34.68 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  34.87 
 
 		 521 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.4 
 
 		 496 aa  280  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  35.63 
 
 		 489 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  34.15 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  34.36 
 
 		 492 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  39.66 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  34.13 
 
 		 665 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  36.63 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  34.81 
 
 		 495 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.49 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 489 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  33.68 
 
 		 496 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  34.18 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  36.02 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  36.26 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  35.55 
 
 		 512 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  34.7 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  32.09 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  31.79 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  33.27 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  35.53 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  32.72 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  29.13 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  29.57 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  28.6 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  29.1 
 
 		 548 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  28.61 
 
 		 545 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  27.21 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  27.21 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  29.44 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.45 
 
 		 727 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  31.75 
 
 		 1301 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  28.14 
 
 		 732 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.35 
 
 		 718 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.6 
 
 		 732 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 641 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.55 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  34.56 
 
 		 629 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  32.56 
 
 		 691 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  31.64 
 
 		 775 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  31.79 
 
 		 632 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  33.33 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 		 715 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.56 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.18 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.68 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.57 
 
 		 736 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.8 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.8 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.1 
 
 		 620 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>