More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1180 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 550 aa  1100    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  56.22 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  52.11 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  46.23 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  45.84 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  45.65 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  43.73 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  43.8 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  42.16 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  41.75 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  43 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  41.24 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  41.52 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  42 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  41.57 
 
 		 503 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  39.96 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  42.42 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 		 504 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 		 504 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  40.46 
 
 		 492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  40.08 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  40.46 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  42.57 
 
 		 492 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  41.81 
 
 		 501 aa  350  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  38.57 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  37.88 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  41.11 
 
 		 496 aa  336  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  38.57 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  37.5 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  41.47 
 
 		 496 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  41.54 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  36.31 
 
 		 519 aa  326  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  36.7 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  36.31 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  36.33 
 
 		 516 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  36.33 
 
 		 503 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  36.33 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  36.14 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  38.22 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  36.47 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  39.09 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  39.91 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  36.1 
 
 		 495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  37.91 
 
 		 665 aa  306  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  38.43 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  37.55 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  37.35 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  36.07 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  38.83 
 
 		 498 aa  299  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  37.85 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  36.59 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  35.67 
 
 		 489 aa  292  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  36.47 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  36.83 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  37.94 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  35.09 
 
 		 489 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  35.88 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  38.3 
 
 		 495 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  37.82 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.84 
 
 		 540 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  34.62 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  36.22 
 
 		 499 aa  259  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  39.66 
 
 		 499 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  37.38 
 
 		 500 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  30.49 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  31.95 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  26.82 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  27.73 
 
 		 545 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  30.39 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  29.56 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.48 
 
 		 731 aa  128  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  31.14 
 
 		 567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.89 
 
 		 731 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.25 
 
 		 731 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.25 
 
 		 731 aa  121  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  30.86 
 
 		 804 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.28 
 
 		 732 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.15 
 
 		 784 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 		 737 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.02 
 
 		 727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.05 
 
 		 721 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  31.73 
 
 		 775 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  32.2 
 
 		 607 aa  117  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.86 
 
 		 800 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.35 
 
 		 736 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  30 
 
 		 754 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.95 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.15 
 
 		 781 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  27.36 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>