More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1090 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 501 aa  1003    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  76.25 
 
 		 492 aa  747    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  34.5 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  35.33 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  35.55 
 
 		 512 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  35.27 
 
 		 512 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  33.4 
 
 		 503 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 503 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  29.35 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  29.35 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  32.81 
 
 		 504 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  30.43 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  31.27 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  32.88 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 503 aa  233  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  28.95 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  31.76 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  30.49 
 
 		 550 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  31.3 
 
 		 552 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  31.23 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  32.48 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  32.97 
 
 		 501 aa  217  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  34.08 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  31.61 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  28.99 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  29.04 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  28.05 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  28.99 
 
 		 492 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  33.2 
 
 		 493 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 490 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  30.97 
 
 		 495 aa  203  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  32.38 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  29.64 
 
 		 519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  28.17 
 
 		 488 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  29.64 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  28.34 
 
 		 488 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  29.44 
 
 		 521 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  29.9 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  31.76 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  29.37 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  30.41 
 
 		 665 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  29.17 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  29.84 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  28.4 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  29.17 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  29.17 
 
 		 503 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  27.79 
 
 		 488 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  31.83 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  30.58 
 
 		 512 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  30.24 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  33.01 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  32.12 
 
 		 489 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  29.11 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  28.11 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  30.17 
 
 		 509 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  29.13 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 		 491 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  30.22 
 
 		 496 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  32.27 
 
 		 489 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  29.73 
 
 		 498 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  28.91 
 
 		 497 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  32.27 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  29.6 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  28.91 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  31.26 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  36.04 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  35.01 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  35.84 
 
 		 499 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  33.49 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  28.71 
 
 		 534 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  32.08 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  35.91 
 
 		 545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  25.41 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  26.78 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  34.07 
 
 		 548 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  26.41 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  26.41 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  30.4 
 
 		 732 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.94 
 
 		 701 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.26 
 
 		 737 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.4 
 
 		 721 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  32.42 
 
 		 756 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  27.85 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.98 
 
 		 736 aa  94.7  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.12 
 
 		 784 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  28.63 
 
 		 721 aa  93.6  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.18 
 
 		 742 aa  93.6  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.68 
 
 		 781 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.19 
 
 		 800 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.47 
 
 		 740 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.82 
 
 		 737 aa  92.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.64 
 
 		 742 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.38 
 
 		 756 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  27.85 
 
 		 337 aa  90.9  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>