More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0575 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  68.38 
 
 		 492 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  73.83 
 
 		 496 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  82.86 
 
 		 496 aa  803    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  100 
 
 		 496 aa  991    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  72.19 
 
 		 492 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  67.97 
 
 		 492 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  56.79 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  58.02 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  57.2 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  57 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  52.37 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  51.84 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  50.52 
 
 		 503 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  49.79 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  49.79 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  52.16 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  48.67 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  49.49 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  45.96 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  44.71 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  45.44 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  45.89 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  43.66 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  41.9 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  41.06 
 
 		 503 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  43.66 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  41.91 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  40.41 
 
 		 504 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  40.99 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  42.68 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  41 
 
 		 552 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  41.54 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  41.15 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  41.15 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 		 545 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  42.14 
 
 		 512 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  37.06 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  39.37 
 
 		 517 aa  306  7e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  38.65 
 
 		 665 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  36.66 
 
 		 495 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  37.04 
 
 		 521 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  37.04 
 
 		 495 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  36.42 
 
 		 519 aa  289  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  38.14 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  36.03 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  36.94 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  39.12 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  35.69 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  35.64 
 
 		 503 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  35.64 
 
 		 516 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 		 503 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  35.34 
 
 		 491 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  36.42 
 
 		 493 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  43.17 
 
 		 499 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  35.58 
 
 		 495 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  35.74 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  34.55 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  35.68 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  35.94 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  43.41 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  35.1 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  43.17 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  35.69 
 
 		 509 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.95 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  34.09 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  35.7 
 
 		 489 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  36.96 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  47.47 
 
 		 540 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  30.24 
 
 		 501 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  29.74 
 
 		 534 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  33.24 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  33.24 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  41.24 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  31.39 
 
 		 545 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  31.53 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.08 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.08 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.2 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.71 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.48 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.58 
 
 		 731 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  34.36 
 
 		 632 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  35.68 
 
 		 538 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.12 
 
 		 727 aa  127  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.11 
 
 		 731 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  37.93 
 
 		 538 aa  126  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  35.66 
 
 		 624 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.19 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  36.8 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.47 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.43 
 
 		 732 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  36.8 
 
 		 615 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  35.5 
 
 		 620 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  37.56 
 
 		 619 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.46 
 
 		 639 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>