More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1030 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  92.94 
 
 		 510 aa  979    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  83.79 
 
 		 517 aa  880    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 512 aa  1047    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  96.29 
 
 		 512 aa  1011    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  45.63 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.4 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  42.37 
 
 		 512 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  40.61 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  42.37 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  42.17 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  40.24 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  43.35 
 
 		 515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  40.47 
 
 		 537 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  40.35 
 
 		 503 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  39.22 
 
 		 499 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  40.12 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.39 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  39.35 
 
 		 504 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  39.04 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  38.78 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  38.78 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  38.87 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  38.76 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  39.53 
 
 		 492 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  39.53 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  39.04 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  39.64 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  38.25 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 		 553 aa  326  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  42.41 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  42.14 
 
 		 492 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  39.51 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  44.14 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  43.61 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  42.14 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  43.33 
 
 		 496 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  38.43 
 
 		 550 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  43.27 
 
 		 545 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  34.72 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  34.47 
 
 		 497 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  38.17 
 
 		 498 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  36.18 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  36.09 
 
 		 495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  35.94 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  38.73 
 
 		 665 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  38.16 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  36.43 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 503 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  33.48 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  33.55 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  34.74 
 
 		 492 aa  251  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  36.02 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  40.86 
 
 		 499 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  41.01 
 
 		 499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  41.43 
 
 		 499 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  33.85 
 
 		 495 aa  246  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  32.96 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.81 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  31.83 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  35.33 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.56 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.31 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 		 517 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  29.11 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  29.66 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  30.26 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  29.53 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  29.52 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  31.97 
 
 		 545 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  36.48 
 
 		 775 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  32.3 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  32.3 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.18 
 
 		 731 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.31 
 
 		 731 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.5 
 
 		 731 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.99 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.17 
 
 		 731 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 		 738 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.79 
 
 		 768 aa  127  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.25 
 
 		 737 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.07 
 
 		 736 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.41 
 
 		 718 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1085  cell division protein FtsH, putative  32.07 
 
 		 538 aa  123  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.81 
 
 		 760 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.77 
 
 		 737 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  31.38 
 
 		 829 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  34.75 
 
 		 732 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0699  cell division protein FtsH  34.29 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  33.33 
 
 		 746 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>