More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  94.73 
 
 
493 aa  949    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  100 
 
 
493 aa  989    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  83.54 
 
 
493 aa  834    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  51.52 
 
 
497 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  50.89 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  51.32 
 
 
490 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  53.47 
 
 
489 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  50.3 
 
 
503 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  50.69 
 
 
503 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  50.61 
 
 
492 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  50.3 
 
 
516 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  50.1 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  49.5 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  51.01 
 
 
491 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  49.19 
 
 
521 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  49.6 
 
 
519 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  50.92 
 
 
489 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  49.4 
 
 
495 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  50.51 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  47.58 
 
 
499 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  44.67 
 
 
512 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  44.06 
 
 
512 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  43.98 
 
 
512 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38 
 
 
503 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 
553 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 
503 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 
503 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  37.3 
 
 
503 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.02 
 
 
502 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  37.05 
 
 
506 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  38.09 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  36.71 
 
 
503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  37.73 
 
 
504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  36.59 
 
 
495 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  37.68 
 
 
512 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  38.17 
 
 
491 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  36.2 
 
 
545 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.83 
 
 
550 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.09 
 
 
498 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  38.16 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.77 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  38.8 
 
 
515 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  36.68 
 
 
509 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  38.57 
 
 
537 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  34.78 
 
 
488 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  34.6 
 
 
488 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  36.56 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  34.58 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.73 
 
 
492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  37.14 
 
 
496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  36.33 
 
 
492 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  34.9 
 
 
504 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  35.94 
 
 
512 aa  267  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  35.61 
 
 
512 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 
510 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  34.67 
 
 
503 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  33.6 
 
 
499 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  34.75 
 
 
503 aa  263  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  34.08 
 
 
504 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  34.08 
 
 
504 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  36.02 
 
 
507 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.22 
 
 
496 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  36.56 
 
 
501 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 
665 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  37.39 
 
 
496 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 
517 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  39.62 
 
 
499 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  39.18 
 
 
499 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  39.28 
 
 
499 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 
501 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  35.16 
 
 
540 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  33.68 
 
 
492 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.31 
 
 
500 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  29.15 
 
 
534 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 
471 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  45.58 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  32.93 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  28.11 
 
 
540 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.82 
 
 
732 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.55 
 
 
718 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.58 
 
 
727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.67 
 
 
701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.94 
 
 
753 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.93 
 
 
760 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.79 
 
 
715 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  32.21 
 
 
1301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  34.76 
 
 
732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.91 
 
 
775 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  35.29 
 
 
718 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  34.4 
 
 
703 aa  114  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  29.76 
 
 
533 aa  113  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.82 
 
 
810 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.72 
 
 
759 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  37.17 
 
 
691 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.92 
 
 
781 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.1 
 
 
673 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.48 
 
 
800 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>