More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3611 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  75.56 
 
 		 489 aa  778    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  100 
 
 		 495 aa  1017    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  85.29 
 
 		 503 aa  893    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  85.29 
 
 		 503 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  85.09 
 
 		 503 aa  892    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  85.29 
 
 		 516 aa  893    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  76.36 
 
 		 489 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  73.35 
 
 		 491 aa  768    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  74.9 
 
 		 489 aa  785    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  94.55 
 
 		 521 aa  964    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  93.74 
 
 		 495 aa  962    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  93.33 
 
 		 519 aa  956    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  76.11 
 
 		 490 aa  799    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  53.23 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  50.61 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  49.8 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  49.4 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  48.09 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  44.78 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  45.77 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  40.52 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  40.52 
 
 		 512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  40.72 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.84 
 
 		 503 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38.62 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  38.59 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  38.41 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  38.41 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  38.93 
 
 		 503 aa  329  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  38.24 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  38.81 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  36.08 
 
 		 552 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  36.61 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.1 
 
 		 550 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  36.57 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  38.28 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  36.42 
 
 		 512 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  36.03 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  38.37 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  36.38 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  36.14 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  36.14 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  35.93 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  34.38 
 
 		 545 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  35.1 
 
 		 499 aa  286  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  36.64 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  35.34 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  36.9 
 
 		 488 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  36.64 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  36.35 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  34.81 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  34.56 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  35.06 
 
 		 491 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  36.73 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  34.36 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  35.2 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  34.66 
 
 		 665 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  34.82 
 
 		 492 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  35.23 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  35.58 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  35.9 
 
 		 496 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  33.55 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  33.85 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  33.85 
 
 		 510 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  31.65 
 
 		 517 aa  243  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.46 
 
 		 517 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  32.44 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  34.51 
 
 		 499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  34.23 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  34.43 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.17 
 
 		 501 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  33.81 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  31.19 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  28.48 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  37.6 
 
 		 548 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  31.88 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.95 
 
 		 732 aa  126  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.75 
 
 		 763 aa  123  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.28 
 
 		 757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  35.93 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.94 
 
 		 800 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.64 
 
 		 718 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 781 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.89 
 
 		 673 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.41 
 
 		 784 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.68 
 
 		 727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.12 
 
 		 701 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  28.99 
 
 		 699 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  26.48 
 
 		 540 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.57 
 
 		 754 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  32.74 
 
 		 776 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  26.45 
 
 		 739 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.75 
 
 		 713 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.85 
 
 		 731 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  34.08 
 
 		 558 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.15 
 
 		 754 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.03 
 
 		 731 aa  114  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.84 
 
 		 754 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  32.84 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>