More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0905 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  75.56 
 
 		 495 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 491 aa  984    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  64.5 
 
 		 498 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  55.58 
 
 		 495 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  41.06 
 
 		 503 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.61 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  41.09 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  40.08 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  40.08 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  40.79 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  39.79 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  39.43 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  38.66 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  39.92 
 
 		 512 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  39.92 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  39.18 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  38.51 
 
 		 499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  36.68 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  38.17 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  37.94 
 
 		 503 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  36.6 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  36.61 
 
 		 553 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  37.97 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  37.47 
 
 		 504 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  37.93 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  38.22 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  38.41 
 
 		 493 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  36.59 
 
 		 507 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.23 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  38.37 
 
 		 550 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  36.02 
 
 		 492 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  35.74 
 
 		 512 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  33.27 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  33.27 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  33.27 
 
 		 503 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  33.66 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  33.95 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  34.1 
 
 		 488 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 		 519 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  34.1 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  33.68 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  34.76 
 
 		 521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  36.23 
 
 		 496 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  34.69 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  35.41 
 
 		 496 aa  269  8e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  35.06 
 
 		 495 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  37.23 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  35.57 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  32.66 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  36.09 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  36.98 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  33.6 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  37.09 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  36.5 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  37.16 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.06 
 
 		 491 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  35.66 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  31.31 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  31.5 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 		 665 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  34.12 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  35.34 
 
 		 499 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  37.72 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  34.71 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  33.73 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  35.76 
 
 		 500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  29.58 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  30.89 
 
 		 534 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  29.65 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  29.81 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  26.09 
 
 		 509 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  26.09 
 
 		 509 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  34.8 
 
 		 775 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 651 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.48 
 
 		 732 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  35.92 
 
 		 632 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 631 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 631 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 631 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.91 
 
 		 628 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.91 
 
 		 628 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.32 
 
 		 627 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  34.91 
 
 		 628 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 631 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  35.38 
 
 		 628 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 649 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 627 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>