More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0892 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  81.6 
 
 		 489 aa  822    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  75.55 
 
 		 516 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  75.56 
 
 		 495 aa  779    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  1004    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  75.55 
 
 		 503 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  75.55 
 
 		 503 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  75.35 
 
 		 503 aa  790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  80.24 
 
 		 491 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  83.61 
 
 		 489 aa  838    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  75.41 
 
 		 490 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  75.76 
 
 		 521 aa  791    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  75.96 
 
 		 495 aa  795    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  75.96 
 
 		 519 aa  795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  55.78 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  53.56 
 
 		 493 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  53.47 
 
 		 493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  49.59 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  52.42 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  47.67 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  47.66 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  41.38 
 
 		 512 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  41.38 
 
 		 512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  41.38 
 
 		 512 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.24 
 
 		 506 aa  342  7e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.67 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38.24 
 
 		 503 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 503 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 503 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  37.47 
 
 		 553 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.67 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  37.53 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 		 552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  37.24 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  37.94 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 		 550 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  35.03 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  36.33 
 
 		 503 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  36.05 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  35.63 
 
 		 495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  35.44 
 
 		 488 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  36.72 
 
 		 492 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.93 
 
 		 492 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  36.52 
 
 		 537 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.23 
 
 		 488 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  33.81 
 
 		 504 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  34.69 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  36.44 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  34.44 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  34.44 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  37.06 
 
 		 496 aa  277  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  35.52 
 
 		 507 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  35.86 
 
 		 492 aa  276  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  35.09 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.1 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  34.08 
 
 		 495 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  36.28 
 
 		 491 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  35.63 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  32.87 
 
 		 545 aa  266  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 		 665 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  36.23 
 
 		 496 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  34.45 
 
 		 512 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  34 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.78 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  33.41 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.93 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  33.66 
 
 		 540 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  33.82 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  32.99 
 
 		 499 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  32.99 
 
 		 499 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  32.36 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  32.76 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.63 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  28.09 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  43.86 
 
 		 548 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.64 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  35.74 
 
 		 673 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.13 
 
 		 718 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.25 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  35.45 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  33.12 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  35.45 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 		 701 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.49 
 
 		 784 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.97 
 
 		 800 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  27.46 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  27.46 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.88 
 
 		 775 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.78 
 
 		 393 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  35.96 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  27.98 
 
 		 533 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.5 
 
 		 727 aa  113  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.13 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30.84 
 
 		 810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  33.48 
 
 		 713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.53 
 
 		 685 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  35.51 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  32.13 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>