More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2745 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  100 
 
 		 495 aa  994    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  75.56 
 
 		 491 aa  748    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  63.58 
 
 		 498 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  54.05 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  40.33 
 
 		 503 aa  349  6e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  39.1 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.73 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  39.1 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  43.11 
 
 		 512 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  43.11 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.71 
 
 		 502 aa  334  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  43.11 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.28 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  39.18 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  38.54 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  36.97 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  36.99 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 512 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  38.92 
 
 		 493 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  38.13 
 
 		 552 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  37.83 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  37.17 
 
 		 537 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  37.04 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  37.37 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  37.37 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 504 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 504 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  41.67 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  35.27 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  37.27 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  35.06 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  38.16 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  36.04 
 
 		 507 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  37.53 
 
 		 493 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  36.44 
 
 		 503 aa  279  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  38.3 
 
 		 550 aa  279  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  32.85 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  35.55 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  32.51 
 
 		 488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  37.83 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.11 
 
 		 496 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  35.15 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  31.89 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  36.09 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  31.89 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  33.85 
 
 		 503 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  33.67 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  33.98 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  33.98 
 
 		 516 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  33.46 
 
 		 503 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  34.08 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  34.19 
 
 		 495 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  32.87 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  35.23 
 
 		 495 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  37.01 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 489 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 		 512 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  35.9 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  33.66 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  35.91 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 		 491 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  34.73 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  32.32 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  34.74 
 
 		 665 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  35.09 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  38.57 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  36.98 
 
 		 499 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  38.89 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  31.31 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  32.67 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.26 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.24 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  29.07 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  27.56 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  27.56 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  26.25 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.59 
 
 		 627 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  34.4 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.61 
 
 		 651 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.88 
 
 		 607 aa  113  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  31.25 
 
 		 804 aa  113  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.61 
 
 		 628 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.61 
 
 		 628 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.33 
 
 		 775 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  35.15 
 
 		 647 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.64 
 
 		 650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  35.15 
 
 		 644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.61 
 
 		 631 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  32.91 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  34.63 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.63 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.63 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  33.47 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  33.95 
 
 		 691 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  33.19 
 
 		 638 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.64 
 
 		 654 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>