More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1374 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  100 
 
 
492 aa  1011    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  51 
 
 
503 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  51 
 
 
503 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  51 
 
 
516 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  50.8 
 
 
503 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  50.61 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  50.71 
 
 
521 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  50.71 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  51.12 
 
 
493 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  50.1 
 
 
519 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  50.4 
 
 
493 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  49.8 
 
 
497 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  50.61 
 
 
493 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  50.61 
 
 
495 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  49.59 
 
 
489 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  49.59 
 
 
489 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 
489 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  48.78 
 
 
491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  47.87 
 
 
494 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  46.04 
 
 
499 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  41.06 
 
 
512 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  41.34 
 
 
512 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 
512 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  36.22 
 
 
506 aa  336  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38.18 
 
 
503 aa  333  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 
503 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 
503 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  37.78 
 
 
504 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.6 
 
 
498 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  37.42 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  36.75 
 
 
503 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  36.4 
 
 
553 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  37.55 
 
 
503 aa  315  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  36.78 
 
 
552 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  37.27 
 
 
504 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  37.04 
 
 
503 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  37.07 
 
 
504 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  37.07 
 
 
504 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  37.68 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  37.12 
 
 
492 aa  309  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  36.08 
 
 
496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.1 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  36.12 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  36.94 
 
 
503 aa  303  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  36.68 
 
 
491 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  35.89 
 
 
492 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  36.99 
 
 
495 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  35.82 
 
 
488 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  36.23 
 
 
488 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.61 
 
 
488 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  37.06 
 
 
496 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.07 
 
 
550 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  35.61 
 
 
488 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 
545 aa  293  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 
537 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  37.27 
 
 
495 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 
665 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  36.8 
 
 
515 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  35.76 
 
 
512 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  37.76 
 
 
496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  36.44 
 
 
501 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  35.54 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  31.77 
 
 
517 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  34.42 
 
 
512 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.82 
 
 
510 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  34.74 
 
 
512 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  34.51 
 
 
517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  35.44 
 
 
499 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 
499 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  35.23 
 
 
499 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  31.64 
 
 
540 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  32.38 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 
492 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  27.77 
 
 
534 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  25.05 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  34.24 
 
 
548 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  29.95 
 
 
509 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  29.95 
 
 
509 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.49 
 
 
540 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  33.47 
 
 
703 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  40.8 
 
 
471 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.21 
 
 
732 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  32.71 
 
 
803 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.89 
 
 
721 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.77 
 
 
753 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36 
 
 
727 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  37.3 
 
 
426 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  31.58 
 
 
538 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.2 
 
 
730 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  35.24 
 
 
386 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.89 
 
 
739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  29.09 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.48 
 
 
754 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.89 
 
 
775 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  31.2 
 
 
538 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  32.88 
 
 
558 aa  114  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1262  AAA ATPase central domain protein  32.87 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.610508  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.81 
 
 
737 aa  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 
459 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>