More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01640 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  100 
 
 		 1159 aa  2331    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  51.24 
 
 		 956 aa  257  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  45.45 
 
 		 337 aa  216  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  38.74 
 
 		 357 aa  192  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  42.67 
 
 		 408 aa  180  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  38.52 
 
 		 370 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  38.08 
 
 		 410 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_6399  predicted protein  43.05 
 
 		 290 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458224  normal  0.109876 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41501  predicted protein  38.67 
 
 		 449 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364066  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  41.18 
 
 		 405 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  37.86 
 
 		 379 aa  161  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.41 
 
 		 738 aa  159  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  37.55 
 
 		 393 aa  159  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  41.1 
 
 		 394 aa  158  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  45.08 
 
 		 645 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.56 
 
 		 639 aa  157  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.66 
 
 		 738 aa  156  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.49 
 
 		 731 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.6 
 
 		 754 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.75 
 
 		 754 aa  154  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  40.44 
 
 		 412 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  37.3 
 
 		 810 aa  154  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.42 
 
 		 673 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.42 
 
 		 673 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.6 
 
 		 607 aa  153  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.89 
 
 		 731 aa  153  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.03 
 
 		 657 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  45.41 
 
 		 550 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.65 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  34.11 
 
 		 442 aa  152  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.87 
 
 		 757 aa  152  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  37.45 
 
 		 421 aa  152  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  34.07 
 
 		 434 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  37.07 
 
 		 433 aa  151  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.29 
 
 		 737 aa  151  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  40 
 
 		 404 aa  150  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_2208  predicted protein  40.34 
 
 		 303 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.1 
 
 		 667 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36 
 
 		 721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  35.81 
 
 		 439 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.77 
 
 		 731 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.12 
 
 		 622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  37.74 
 
 		 829 aa  150  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.31 
 
 		 687 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.91 
 
 		 659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.58 
 
 		 784 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.2 
 
 		 753 aa  149  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  37.29 
 
 		 739 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.58 
 
 		 800 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.58 
 
 		 781 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  38.91 
 
 		 393 aa  148  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.7 
 
 		 652 aa  148  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  43.44 
 
 		 464 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.08 
 
 		 656 aa  148  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.88 
 
 		 735 aa  148  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.52 
 
 		 651 aa  148  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  36.97 
 
 		 404 aa  147  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.37 
 
 		 609 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000237353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.52 
 
 		 620 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.12 
 
 		 727 aa  147  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.95 
 
 		 737 aa  147  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  42.42 
 
 		 619 aa  147  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.14 
 
 		 756 aa  147  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  39.15 
 
 		 784 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  29.49 
 
 		 443 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 810 aa  147  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.17 
 
 		 714 aa  147  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  35.06 
 
 		 775 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  37.29 
 
 		 412 aa  147  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.25 
 
 		 754 aa  147  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.04 
 
 		 660 aa  147  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.61 
 
 		 718 aa  147  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.34 
 
 		 651 aa  147  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.97 
 
 		 608 aa  146  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.32 
 
 		 623 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 		 653 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.91 
 
 		 643 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.01 
 
 		 763 aa  146  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.01 
 
 		 647 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  41.84 
 
 		 621 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  38.4 
 
 		 652 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  43.15 
 
 		 625 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.46 
 
 		 754 aa  145  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  43.52 
 
 		 627 aa  146  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.89 
 
 		 617 aa  146  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.08 
 
 		 638 aa  146  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  41.41 
 
 		 499 aa  146  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.27 
 
 		 759 aa  145  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  38.96 
 
 		 682 aa  145  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  37.35 
 
 		 416 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.82 
 
 		 620 aa  145  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 		 424 aa  145  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.66 
 
 		 640 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.12 
 
 		 736 aa  145  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.08 
 
 		 757 aa  145  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  38.77 
 
 		 803 aa  145  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  39.3 
 
 		 746 aa  145  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.49 
 
 		 639 aa  145  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39 
 
 		 633 aa  145  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  34.45 
 
 		 806 aa  145  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>