More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0141 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
609 aa  1240    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000237353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.56 
 
 
619 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.12 
 
 
611 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
616 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
620 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.61 
 
 
599 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.32 
 
 
601 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.41 
 
 
601 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
615 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52 
 
 
614 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
602 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.9 
 
 
693 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
676 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 
639 aa  591  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
632 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
635 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
639 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
655 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.08 
 
 
665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 
617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.34 
 
 
612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
612 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.15 
 
 
608 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.41 
 
 
608 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  50.57 
 
 
633 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  50.9 
 
 
633 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  50.73 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
599 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
612 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  49.92 
 
 
659 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  50.74 
 
 
633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.71 
 
 
672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
621 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.42 
 
 
638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  50.08 
 
 
682 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  50.33 
 
 
645 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 
657 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 
697 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  50.25 
 
 
650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 
697 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  51.55 
 
 
656 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 
614 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  57.17 
 
 
616 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
657 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.58 
 
 
657 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
657 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 
671 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.48 
 
 
652 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  49.92 
 
 
649 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
657 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
657 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.23 
 
 
637 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
657 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
652 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.18 
 
 
643 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
646 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
656 aa  568  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
637 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.08 
 
 
657 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.08 
 
 
657 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
650 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.16 
 
 
656 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  50.97 
 
 
700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.48 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.92 
 
 
657 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.88 
 
 
636 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.15 
 
 
753 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  48.96 
 
 
617 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.25 
 
 
637 aa  558  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  49.28 
 
 
617 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.87 
 
 
681 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.04 
 
 
640 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  57.41 
 
 
654 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  48.96 
 
 
617 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 
643 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 
653 aa  556  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 
647 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  47.76 
 
 
644 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 
643 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  48.33 
 
 
643 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  57.56 
 
 
753 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  47.76 
 
 
647 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 
638 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
610 aa  555  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  49.67 
 
 
627 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.36 
 
 
759 aa  556  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.95 
 
 
640 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 
651 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.07 
 
 
673 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  50 
 
 
681 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
647 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 
682 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.41 
 
 
641 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>