More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2065 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2065  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 
422 aa  848    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.812817 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  34.97 
 
 
813 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  35.41 
 
 
824 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.23 
 
 
862 aa  159  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  33.94 
 
 
811 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  34.39 
 
 
812 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  38.79 
 
 
869 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  33.99 
 
 
834 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  32.11 
 
 
835 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  32.29 
 
 
812 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  33.33 
 
 
814 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  32.36 
 
 
824 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  32.3 
 
 
842 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  37.59 
 
 
825 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  32.78 
 
 
876 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  33.52 
 
 
837 aa  156  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  36.14 
 
 
722 aa  156  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  35.91 
 
 
825 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  33.54 
 
 
812 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  34.58 
 
 
848 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0127  ATPase AAA-2 domain protein  35.34 
 
 
814 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  31.37 
 
 
789 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0010  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  33.9 
 
 
859 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169656 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  31.68 
 
 
841 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  32.48 
 
 
814 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  31.61 
 
 
789 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2175  ATPase AAA-2 domain protein  35.02 
 
 
734 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  37.95 
 
 
887 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  35.61 
 
 
752 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  32.95 
 
 
851 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  31.99 
 
 
842 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  39.24 
 
 
861 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  34.22 
 
 
855 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  33.22 
 
 
823 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  37.93 
 
 
872 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  39.64 
 
 
861 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  34.01 
 
 
871 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  34.62 
 
 
840 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  42.13 
 
 
890 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  37.55 
 
 
863 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  36.68 
 
 
860 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  31.99 
 
 
843 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  34.6 
 
 
818 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  38.99 
 
 
871 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  34.39 
 
 
824 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  33.55 
 
 
810 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  34.47 
 
 
825 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0537  ATP-dependent chaperone protein ClpB  30.91 
 
 
857 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.520479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  34.6 
 
 
879 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00690  ATP-dependent chaperone ClpB  39.73 
 
 
871 aa  153  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  35.18 
 
 
862 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  32.09 
 
 
810 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  38.94 
 
 
862 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1422  ATP-dependent chaperone protein ClpB  30.61 
 
 
859 aa  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.727598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3055  ATPase AAA-2  35.81 
 
 
801 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800011  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  34.62 
 
 
859 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  33.23 
 
 
810 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1400  ATPase AAA-2 domain protein  34.52 
 
 
856 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000354878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  32.62 
 
 
818 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06361  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  32.32 
 
 
863 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344942  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  35.71 
 
 
783 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.177783  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  34.77 
 
 
825 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  34.1 
 
 
852 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  34.62 
 
 
815 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0616  ATP-dependent chaperone protein ClpB  30.61 
 
 
857 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  33.92 
 
 
855 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  35.82 
 
 
924 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  38.99 
 
 
871 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  33.11 
 
 
852 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  35.79 
 
 
837 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  35.09 
 
 
848 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  35.33 
 
 
839 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5345  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  34.97 
 
 
832 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  31.25 
 
 
818 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  32.93 
 
 
840 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  36.78 
 
 
863 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  33.92 
 
 
825 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  38.07 
 
 
870 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  35.25 
 
 
748 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  31.25 
 
 
818 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  35.43 
 
 
861 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  38.07 
 
 
870 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4502  ATPase AAA-2 domain protein  37.64 
 
 
761 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.58949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  34.19 
 
 
847 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  38.07 
 
 
870 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  32.06 
 
 
854 aa  150  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  33.33 
 
 
858 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0465  hypothetical protein  33.59 
 
 
842 aa  150  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  38.53 
 
 
893 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  34.57 
 
 
863 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01200  ATP-dependent chaperone ClpB  36.33 
 
 
891 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  32.36 
 
 
818 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2092  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  33.89 
 
 
792 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  40.37 
 
 
867 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  35.22 
 
 
854 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  37.34 
 
 
863 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3812  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  35.29 
 
 
772 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356989  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0787  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  35.02 
 
 
828 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.165344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  32.08 
 
 
817 aa  150  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  29.4 
 
 
815 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>