More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1828 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.67 
 
 
858 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  41.87 
 
 
812 aa  654    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  44 
 
 
806 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.22 
 
 
817 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  44.1 
 
 
851 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  45.27 
 
 
812 aa  690    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  100 
 
 
815 aa  1655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  46.14 
 
 
811 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  42.11 
 
 
812 aa  654    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  46.05 
 
 
830 aa  736    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  43.61 
 
 
819 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  44.43 
 
 
818 aa  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  43.46 
 
 
846 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  45.1 
 
 
830 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.73 
 
 
851 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  45.09 
 
 
810 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  42.86 
 
 
814 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.65 
 
 
844 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  43.88 
 
 
841 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  43.9 
 
 
816 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  44.08 
 
 
852 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  45.41 
 
 
811 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  42.72 
 
 
825 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  43.22 
 
 
812 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.74 
 
 
879 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  44.28 
 
 
835 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.83 
 
 
824 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  43.63 
 
 
890 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  42.58 
 
 
812 aa  656    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  44.98 
 
 
829 aa  683    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  44.86 
 
 
818 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.62 
 
 
840 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  43.9 
 
 
814 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  44.36 
 
 
858 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  44.47 
 
 
837 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  43.08 
 
 
847 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  43.68 
 
 
814 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  42.72 
 
 
820 aa  644    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  43.87 
 
 
855 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  42.22 
 
 
834 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  44.43 
 
 
818 aa  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  44.39 
 
 
810 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  42.06 
 
 
850 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.34 
 
 
866 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.89 
 
 
834 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  43.79 
 
 
836 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  46.3 
 
 
811 aa  684    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.21 
 
 
828 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.18 
 
 
811 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  44.81 
 
 
869 aa  657    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.14 
 
 
811 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  42.75 
 
 
812 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  44.52 
 
 
840 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.44 
 
 
816 aa  773    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.42 
 
 
823 aa  733    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  45.43 
 
 
811 aa  713    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.63 
 
 
838 aa  715    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  43.27 
 
 
834 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.12 
 
 
826 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0109  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  72.64 
 
 
816 aa  1209    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  44.18 
 
 
812 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  43.49 
 
 
830 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  43.53 
 
 
862 aa  652    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  44.82 
 
 
842 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  42.93 
 
 
839 aa  656    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.1897600000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  44.72 
 
 
826 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.35 
 
 
839 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  42.86 
 
 
854 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.79 
 
 
844 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  42.7 
 
 
861 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.79 
 
 
836 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  42.84 
 
 
847 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  43.25 
 
 
860 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  42.33 
 
 
829 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  43.99 
 
 
830 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  45.26 
 
 
810 aa  715    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  43.65 
 
 
848 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  41.51 
 
 
834 aa  646    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.01 
 
 
811 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  41.58 
 
 
823 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  42.51 
 
 
852 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  41.25 
 
 
868 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1186  ATPase AAA-2 domain protein  42.5 
 
 
876 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0316758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  42.84 
 
 
847 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  43.27 
 
 
834 aa  635  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  42.86 
 
 
853 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.45 
 
 
854 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  43.37 
 
 
850 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  42.28 
 
 
822 aa  635  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  42.67 
 
 
854 aa  631  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  42.14 
 
 
823 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  42.19 
 
 
847 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  42.96 
 
 
847 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.23 
 
 
824 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  42.99 
 
 
822 aa  630  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>