More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0514 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  45.19 
 
 		 857 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  45.19 
 
 		 857 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  44.74 
 
 		 870 aa  714    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.53 
 
 		 824 aa  764    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  47.11 
 
 		 812 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  45.4 
 
 		 865 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  43.84 
 
 		 863 aa  694    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  42.68 
 
 		 832 aa  678    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  52.8 
 
 		 817 aa  874    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.38 
 
 		 859 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.81 
 
 		 811 aa  848    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.88 
 
 		 866 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.56 
 
 		 861 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.42 
 
 		 815 aa  733    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  43.29 
 
 		 857 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.81 
 
 		 811 aa  848    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  53.81 
 
 		 811 aa  848    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  53.81 
 
 		 811 aa  849    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  44.43 
 
 		 858 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  43.58 
 
 		 858 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  44.12 
 
 		 854 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  47.09 
 
 		 830 aa  761    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  48.99 
 
 		 855 aa  785    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.04 
 
 		 942 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  46.1 
 
 		 873 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  44 
 
 		 876 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  50.93 
 
 		 823 aa  808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  45.33 
 
 		 872 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  50 
 
 		 814 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  42.47 
 
 		 872 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  46.95 
 
 		 847 aa  749    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.09 
 
 		 862 aa  713    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  48.86 
 
 		 843 aa  783    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  45.61 
 
 		 863 aa  721    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  45.17 
 
 		 862 aa  683    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  48.74 
 
 		 846 aa  783    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  45.47 
 
 		 864 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.81 
 
 		 811 aa  848    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  49.15 
 
 		 842 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  50.6 
 
 		 824 aa  806    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  46.08 
 
 		 883 aa  713    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 840 aa  777    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  47.61 
 
 		 834 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  43.32 
 
 		 879 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  43.86 
 
 		 865 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  45.17 
 
 		 869 aa  696    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  46.45 
 
 		 818 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  45.37 
 
 		 878 aa  703    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  47.95 
 
 		 861 aa  678    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  46.34 
 
 		 847 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  54.84 
 
 		 837 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  49.94 
 
 		 886 aa  741    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  50 
 
 		 834 aa  830    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  44.2 
 
 		 891 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  43.77 
 
 		 848 aa  734    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.14 
 
 		 814 aa  756    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  47.9 
 
 		 814 aa  750    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  45.96 
 
 		 870 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  49.88 
 
 		 825 aa  798    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  49.01 
 
 		 825 aa  780    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  49.51 
 
 		 864 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 828 aa  828    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  47.58 
 
 		 850 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  44.31 
 
 		 854 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.88 
 
 		 816 aa  854    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  100 
 
 		 823 aa  1669    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  56.1 
 
 		 838 aa  917    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  67.28 
 
 		 826 aa  1098    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0109  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 816 aa  737    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  48.65 
 
 		 830 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  43.51 
 
 		 873 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  48.01 
 
 		 839 aa  780    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  45.17 
 
 		 864 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  43.81 
 
 		 873 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  46.62 
 
 		 854 aa  749    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  46.49 
 
 		 861 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  46.34 
 
 		 847 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  46.47 
 
 		 847 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  45.73 
 
 		 865 aa  686    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  49.58 
 
 		 842 aa  786    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  49.52 
 
 		 843 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  49.11 
 
 		 855 aa  786    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  48.21 
 
 		 859 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  45.85 
 
 		 863 aa  705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  51.61 
 
 		 818 aa  835    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1019  ATPase  48.19 
 
 		 857 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00163715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  46.34 
 
 		 847 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  49.52 
 
 		 841 aa  791    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  52.03 
 
 		 812 aa  853    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  46.22 
 
 		 847 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  47.79 
 
 		 840 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  48.92 
 
 		 848 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  47.08 
 
 		 844 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3072  protein disaggregation chaperone  45.65 
 
 		 857 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000111727  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1024  ATPase  43.4 
 
 		 857 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2583  ATPase  44.13 
 
 		 848 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.444308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  43.57 
 
 		 867 aa  699    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  48.66 
 
 		 824 aa  771    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  47.17 
 
 		 812 aa  747    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  42.89 
 
 		 857 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>