More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1526 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  45.07 
 
 
857 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  45.07 
 
 
857 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  47.54 
 
 
870 aa  781    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.09 
 
 
824 aa  840    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  49.33 
 
 
812 aa  794    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  45.39 
 
 
865 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0010  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.34 
 
 
859 aa  722    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  45.53 
 
 
832 aa  727    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.98 
 
 
817 aa  874    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.06 
 
 
859 aa  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  52.82 
 
 
811 aa  874    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.4 
 
 
861 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.41 
 
 
874 aa  708    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  45.09 
 
 
854 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  52.82 
 
 
811 aa  874    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  52.82 
 
 
811 aa  874    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  52.82 
 
 
811 aa  875    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.29 
 
 
858 aa  717    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.29 
 
 
858 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  45.09 
 
 
854 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  44.32 
 
 
865 aa  702    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.75 
 
 
863 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  50.61 
 
 
830 aa  848    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  51.53 
 
 
855 aa  877    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  43.24 
 
 
891 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  44.13 
 
 
873 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  43.31 
 
 
876 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  52.73 
 
 
823 aa  884    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  44.73 
 
 
872 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  48.9 
 
 
814 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  44.9 
 
 
854 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  46.79 
 
 
949 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  50.12 
 
 
847 aa  866    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  43.88 
 
 
862 aa  725    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  52.52 
 
 
843 aa  880    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  47.99 
 
 
863 aa  800    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  44.33 
 
 
862 aa  702    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  51.76 
 
 
846 aa  885    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  44.31 
 
 
864 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  52.82 
 
 
811 aa  874    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  51.91 
 
 
842 aa  882    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  53.04 
 
 
824 aa  876    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  43.32 
 
 
883 aa  719    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  44.91 
 
 
870 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.02 
 
 
840 aa  845    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  50.48 
 
 
834 aa  839    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  43.61 
 
 
879 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  43.45 
 
 
859 aa  704    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  45.17 
 
 
949 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  45.69 
 
 
861 aa  725    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  43.97 
 
 
865 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  43.99 
 
 
865 aa  702    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  48.18 
 
 
818 aa  785    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  44.91 
 
 
878 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  45.33 
 
 
862 aa  729    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  45.66 
 
 
859 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  46.55 
 
 
946 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  50.55 
 
 
847 aa  825    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  49.19 
 
 
837 aa  763    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  50.61 
 
 
886 aa  758    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  52.32 
 
 
834 aa  866    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  44.25 
 
 
891 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.36 
 
 
848 aa  842    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  49.63 
 
 
814 aa  795    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  49.5 
 
 
814 aa  789    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  43.04 
 
 
870 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  53.54 
 
 
825 aa  889    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  50.97 
 
 
825 aa  873    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  44.74 
 
 
864 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.81 
 
 
828 aa  889    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  43.5 
 
 
868 aa  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  46.79 
 
 
953 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  44.9 
 
 
854 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.34 
 
 
823 aa  760    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.78 
 
 
838 aa  730    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.15 
 
 
826 aa  724    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  49.17 
 
 
830 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  46.55 
 
 
946 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  51.11 
 
 
839 aa  855    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  44.57 
 
 
873 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  50.42 
 
 
854 aa  867    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  49.26 
 
 
861 aa  821    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  50.55 
 
 
847 aa  825    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  50.61 
 
 
847 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  43.78 
 
 
859 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  45 
 
 
949 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  43.91 
 
 
870 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  52.03 
 
 
842 aa  885    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  52.63 
 
 
843 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  51.65 
 
 
855 aa  879    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  50.81 
 
 
859 aa  881    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  42.83 
 
 
863 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  52.59 
 
 
818 aa  880    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  50.55 
 
 
847 aa  835    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  52.15 
 
 
841 aa  882    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  53.94 
 
 
812 aa  900    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  50.49 
 
 
847 aa  821    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  51.33 
 
 
840 aa  818    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  49.26 
 
 
844 aa  821    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3072  protein disaggregation chaperone  44.81 
 
 
857 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000111727  normal  0.0172614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>