More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0578 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  48.26 
 
 		 811 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  63.75 
 
 		 734 aa  941    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  54.1 
 
 		 821 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  52.58 
 
 		 846 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  48.38 
 
 		 829 aa  637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  54.52 
 
 		 812 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  60.32 
 
 		 725 aa  850    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  51.87 
 
 		 830 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  52.49 
 
 		 817 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.75 
 
 		 862 aa  635    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  53.58 
 
 		 868 aa  658    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  51.99 
 
 		 818 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  74.6 
 
 		 753 aa  1134    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  51.68 
 
 		 869 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  53.59 
 
 		 835 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.96 
 
 		 858 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  54.12 
 
 		 815 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  52.33 
 
 		 810 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.98 
 
 		 837 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  52.9 
 
 		 848 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  51.33 
 
 		 860 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.3 
 
 		 866 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  52.64 
 
 		 812 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  50 
 
 		 830 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  50.9 
 
 		 855 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  51.49 
 
 		 842 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  53.94 
 
 		 823 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  52.99 
 
 		 814 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  54.49 
 
 		 822 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  51.77 
 
 		 818 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  50.77 
 
 		 840 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  49.78 
 
 		 836 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  53.45 
 
 		 843 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  50.61 
 
 		 819 aa  653    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  53.59 
 
 		 846 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  53.31 
 
 		 812 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  59.41 
 
 		 712 aa  819    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  49.15 
 
 		 803 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  52.45 
 
 		 842 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  54.74 
 
 		 824 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  51.2 
 
 		 812 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  55.22 
 
 		 840 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  53.96 
 
 		 834 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.27 
 
 		 879 aa  643    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.62 
 
 		 834 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  53.55 
 
 		 841 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  50.45 
 
 		 852 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  51.66 
 
 		 841 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  51.99 
 
 		 818 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  54.33 
 
 		 822 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  49.49 
 
 		 855 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  52.54 
 
 		 814 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  50.38 
 
 		 830 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  55.2 
 
 		 837 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  49.54 
 
 		 834 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  52.9 
 
 		 850 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  54.21 
 
 		 814 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  54.05 
 
 		 814 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  55.15 
 
 		 825 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  52.9 
 
 		 825 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  54.28 
 
 		 834 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  55.8 
 
 		 810 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  52.22 
 
 		 859 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.28 
 
 		 828 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  56.03 
 
 		 825 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  100 
 
 		 748 aa  1525    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  50.37 
 
 		 824 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  50.85 
 
 		 810 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  60.37 
 
 		 726 aa  827    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  52.4 
 
 		 823 aa  665    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  61.29 
 
 		 722 aa  890    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  47.59 
 
 		 781 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1186  ATPase AAA-2 domain protein  51.27 
 
 		 876 aa  639    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0316758 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  61.49 
 
 		 684 aa  839    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  75.53 
 
 		 752 aa  1139    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  52.02 
 
 		 826 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  50.83 
 
 		 830 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.73 
 
 		 824 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  52.99 
 
 		 847 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  55.61 
 
 		 816 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  52.9 
 
 		 839 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  50.66 
 
 		 854 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  51.69 
 
 		 861 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  57.54 
 
 		 676 aa  742    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  52.73 
 
 		 822 aa  640    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  51.43 
 
 		 815 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  51.69 
 
 		 829 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  52.99 
 
 		 847 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  52.05 
 
 		 811 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  52.93 
 
 		 789 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  51.56 
 
 		 841 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  50.59 
 
 		 842 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  51.97 
 
 		 843 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  50.6 
 
 		 855 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  52.06 
 
 		 859 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  49.63 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  52.91 
 
 		 844 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  52.77 
 
 		 789 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  53.76 
 
 		 886 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  49.93 
 
 		 851 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>