More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1369 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  48.1 
 
 		 857 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  48.1 
 
 		 857 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  48.62 
 
 		 812 aa  744    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  46.47 
 
 		 865 aa  719    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  48.51 
 
 		 940 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.99 
 
 		 817 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.15 
 
 		 859 aa  730    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  48.37 
 
 		 862 aa  727    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.93 
 
 		 811 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.77 
 
 		 861 aa  726    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.93 
 
 		 811 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.93 
 
 		 811 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.93 
 
 		 811 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.89 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  47.31 
 
 		 858 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  47.31 
 
 		 858 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  47.24 
 
 		 865 aa  716    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  51.72 
 
 		 830 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  49.73 
 
 		 855 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.12 
 
 		 942 aa  740    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  47.06 
 
 		 891 aa  725    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  51.63 
 
 		 823 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  46.82 
 
 		 872 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  51.52 
 
 		 814 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  46.13 
 
 		 865 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  50.86 
 
 		 949 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  46.88 
 
 		 865 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  46.37 
 
 		 862 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  51.41 
 
 		 843 aa  746    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  47.66 
 
 		 862 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  50.8 
 
 		 846 aa  739    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  48.94 
 
 		 949 aa  735    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.93 
 
 		 811 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  50.6 
 
 		 842 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  53.14 
 
 		 824 aa  747    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  46.15 
 
 		 883 aa  718    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  47.13 
 
 		 870 aa  719    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.57 
 
 		 840 aa  753    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.13 
 
 		 865 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  48.56 
 
 		 870 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.82 
 
 		 834 aa  742    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  48.33 
 
 		 879 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  47.02 
 
 		 859 aa  723    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  48.45 
 
 		 879 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  48.81 
 
 		 949 aa  732    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  47.97 
 
 		 861 aa  738    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  50.06 
 
 		 961 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  46.84 
 
 		 865 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  48.52 
 
 		 879 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  48.67 
 
 		 860 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  47.54 
 
 		 878 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  47.36 
 
 		 865 aa  718    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  48.07 
 
 		 862 aa  713    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  47.94 
 
 		 861 aa  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  47.36 
 
 		 862 aa  735    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  46.77 
 
 		 859 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  50.67 
 
 		 946 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  47 
 
 		 865 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  51.08 
 
 		 847 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  58.75 
 
 		 837 aa  767    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  60.44 
 
 		 886 aa  895    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  48.33 
 
 		 834 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  47.31 
 
 		 858 aa  717    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  47.04 
 
 		 891 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  45.93 
 
 		 870 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  52.32 
 
 		 825 aa  754    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  51.63 
 
 		 825 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  47.43 
 
 		 864 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 828 aa  773    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  46.56 
 
 		 868 aa  726    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  46.75 
 
 		 865 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  51.55 
 
 		 953 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  50.81 
 
 		 850 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  52.79 
 
 		 830 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  46.7 
 
 		 889 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  54.9 
 
 		 857 aa  854    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  47 
 
 		 865 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  50.67 
 
 		 946 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  52.28 
 
 		 839 aa  759    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  45.68 
 
 		 873 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4012  ATPase  48.63 
 
 		 953 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  51.47 
 
 		 861 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  51.08 
 
 		 847 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  51.48 
 
 		 847 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  48.74 
 
 		 859 aa  732    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  48.4 
 
 		 949 aa  730    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3198  ATPase  49.23 
 
 		 867 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.89 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  50.2 
 
 		 842 aa  729    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  50.27 
 
 		 843 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  49.6 
 
 		 855 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  48.76 
 
 		 859 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.89 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  50.75 
 
 		 818 aa  798    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  46.01 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  46.13 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  51.21 
 
 		 847 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.89 
 
 		 865 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  50.27 
 
 		 841 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  52.14 
 
 		 812 aa  775    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>