More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1763 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2192  ATPase  53.76 
 
 		 836 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  53.58 
 
 		 834 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.15 
 
 		 824 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  54.86 
 
 		 812 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  54.9 
 
 		 813 aa  689    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  52.05 
 
 		 840 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.29 
 
 		 824 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  54.34 
 
 		 817 aa  688    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  51.75 
 
 		 859 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.25 
 
 		 811 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  56.23 
 
 		 811 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  59.26 
 
 		 753 aa  836    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  52.98 
 
 		 792 aa  643    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  52.04 
 
 		 840 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  53.76 
 
 		 844 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.25 
 
 		 811 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  56.25 
 
 		 811 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  56.25 
 
 		 811 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2583  ATPase  51.12 
 
 		 848 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.444308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  54.34 
 
 		 791 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  51.79 
 
 		 830 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  51.75 
 
 		 855 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  52.76 
 
 		 869 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  55.08 
 
 		 823 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  54.09 
 
 		 818 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  55.61 
 
 		 814 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  54.41 
 
 		 847 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  53.35 
 
 		 843 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.74 
 
 		 811 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  53.17 
 
 		 846 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.25 
 
 		 811 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  53.1 
 
 		 842 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  55.47 
 
 		 824 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  52.8 
 
 		 860 aa  642    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  55.18 
 
 		 812 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  54.67 
 
 		 840 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  55.59 
 
 		 834 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  55.06 
 
 		 812 aa  683    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  52.77 
 
 		 826 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  52.74 
 
 		 822 aa  669    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  50.89 
 
 		 824 aa  649    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.25 
 
 		 811 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  54.59 
 
 		 848 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  55.79 
 
 		 818 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  49.86 
 
 		 871 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  57.42 
 
 		 814 aa  676    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  53.54 
 
 		 849 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  52.39 
 
 		 847 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  54.43 
 
 		 847 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  56.41 
 
 		 837 aa  679    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  55.16 
 
 		 823 aa  697    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  55.35 
 
 		 834 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  52.46 
 
 		 789 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  53.61 
 
 		 844 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  52.41 
 
 		 848 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  53.19 
 
 		 814 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  53.34 
 
 		 814 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  53.59 
 
 		 851 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  54.2 
 
 		 825 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  52.28 
 
 		 825 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  59.68 
 
 		 816 aa  702    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  53.11 
 
 		 853 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  53.76 
 
 		 791 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  53.59 
 
 		 830 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  55.8 
 
 		 828 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  58.05 
 
 		 734 aa  828    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  53.43 
 
 		 848 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  59.83 
 
 		 748 aa  825    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.52 
 
 		 823 aa  638    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  56.34 
 
 		 726 aa  732    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  53.75 
 
 		 846 aa  661    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  57.08 
 
 		 722 aa  800    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  50.99 
 
 		 845 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  52.51 
 
 		 822 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  57.4 
 
 		 684 aa  733    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  58.35 
 
 		 752 aa  814    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  53.45 
 
 		 830 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  53.86 
 
 		 857 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  56.3 
 
 		 811 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  55.56 
 
 		 839 aa  676    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  56.39 
 
 		 814 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  53.09 
 
 		 854 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  52.67 
 
 		 792 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  54.21 
 
 		 861 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  50.07 
 
 		 871 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  54.43 
 
 		 847 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  53.53 
 
 		 847 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  54.09 
 
 		 818 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  52.48 
 
 		 842 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  53.32 
 
 		 843 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  51.9 
 
 		 855 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  52.27 
 
 		 859 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  50.73 
 
 		 803 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  56.03 
 
 		 818 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  53.16 
 
 		 824 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  54.43 
 
 		 847 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  52.87 
 
 		 841 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  53.63 
 
 		 849 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  57.49 
 
 		 812 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  54.27 
 
 		 847 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>