More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0571 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  53.19 
 
 
812 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.73 
 
 
854 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.13 
 
 
824 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  52.33 
 
 
812 aa  641    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.85 
 
 
817 aa  661    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  52.57 
 
 
842 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  54.02 
 
 
830 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  53.04 
 
 
810 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  62.48 
 
 
753 aa  804    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  51.56 
 
 
829 aa  649    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  63.73 
 
 
734 aa  880    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  54.02 
 
 
850 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  52.73 
 
 
830 aa  663    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  51.48 
 
 
852 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  51.25 
 
 
830 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19480  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  49.4 
 
 
865 aa  649    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000156144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.85 
 
 
858 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  49.57 
 
 
823 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  53.96 
 
 
814 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1186  ATPase AAA-2 domain protein  51.49 
 
 
876 aa  636    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0316758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  50.15 
 
 
848 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  51.59 
 
 
829 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  49.64 
 
 
871 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  51.78 
 
 
871 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.23 
 
 
879 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  51.28 
 
 
846 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  53.61 
 
 
676 aa  691    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  50.69 
 
 
842 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  50.83 
 
 
824 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.04 
 
 
851 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  50.6 
 
 
818 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  51.32 
 
 
819 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  53 
 
 
840 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.8 
 
 
834 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  52.18 
 
 
825 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  50.55 
 
 
826 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  50.98 
 
 
810 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.55 
 
 
862 aa  636    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  52.04 
 
 
814 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  52.73 
 
 
858 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  50.8 
 
 
822 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.69 
 
 
866 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  53.26 
 
 
868 aa  659    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  53.12 
 
 
837 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  52.9 
 
 
812 aa  644    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  50.7 
 
 
834 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.5 
 
 
814 aa  638    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.5 
 
 
814 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  52.11 
 
 
810 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  51.51 
 
 
825 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  49.2 
 
 
825 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  52.05 
 
 
816 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.33 
 
 
828 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  52.09 
 
 
855 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  52.34 
 
 
834 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  61.49 
 
 
748 aa  839    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.3 
 
 
834 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  68.5 
 
 
726 aa  937    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  52.11 
 
 
811 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  63.45 
 
 
722 aa  822    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  49.4 
 
 
854 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  60.1 
 
 
712 aa  734    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  100 
 
 
684 aa  1400    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  63.39 
 
 
752 aa  797    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  57.53 
 
 
725 aa  748    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  54.02 
 
 
830 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  50.85 
 
 
841 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  53.22 
 
 
836 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  50.76 
 
 
852 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  53.58 
 
 
839 aa  675    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.69 
 
 
862 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  50.76 
 
 
823 aa  651    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  52.57 
 
 
861 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.42 
 
 
837 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  52.5 
 
 
847 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  51.36 
 
 
812 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  52.97 
 
 
851 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  50.6 
 
 
818 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  48.36 
 
 
842 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  51.07 
 
 
843 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  53.22 
 
 
835 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.1 
 
 
815 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  50.37 
 
 
859 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  52.65 
 
 
840 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  54.47 
 
 
803 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  52.86 
 
 
818 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  52.33 
 
 
847 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  50.46 
 
 
841 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  53.05 
 
 
836 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  52.27 
 
 
822 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  52.68 
 
 
781 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  49.41 
 
 
859 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  48.49 
 
 
872 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  51.14 
 
 
821 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  50.76 
 
 
843 aa  635  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  52.27 
 
 
822 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  51.16 
 
 
869 aa  634  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  53.22 
 
 
844 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  52.46 
 
 
814 aa  635  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  52.07 
 
 
841 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>