More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0488 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  50.97 
 
 		 810 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  52.93 
 
 		 821 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  51.31 
 
 		 812 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  49.7 
 
 		 868 aa  635    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  54.12 
 
 		 817 aa  667    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  100 
 
 		 753 aa  1537    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1186  ATPase AAA-2 domain protein  50.45 
 
 		 876 aa  642    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0316758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  59.12 
 
 		 725 aa  846    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  53.69 
 
 		 829 aa  661    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  51.37 
 
 		 859 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  49.93 
 
 		 855 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  52.4 
 
 		 823 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  53 
 
 		 814 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  52.15 
 
 		 822 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  52.76 
 
 		 835 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  49.7 
 
 		 854 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  47.38 
 
 		 781 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  50.67 
 
 		 855 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  51.85 
 
 		 843 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  51.56 
 
 		 848 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  51.3 
 
 		 846 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  49.93 
 
 		 842 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  52.44 
 
 		 824 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  51.82 
 
 		 836 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  49.43 
 
 		 871 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.28 
 
 		 840 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  52.38 
 
 		 850 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  54.15 
 
 		 841 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.68 
 
 		 834 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  53.23 
 
 		 825 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  48.1 
 
 		 803 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  51.69 
 
 		 826 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  50.85 
 
 		 812 aa  635    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  51.2 
 
 		 869 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  52.19 
 
 		 841 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  51.47 
 
 		 824 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  51.11 
 
 		 811 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  50.37 
 
 		 823 aa  669    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  54 
 
 		 812 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  54.79 
 
 		 837 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  51.67 
 
 		 830 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  52.43 
 
 		 819 aa  669    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  51.1 
 
 		 811 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.62 
 
 		 824 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  52.83 
 
 		 815 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  52.44 
 
 		 825 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  53.79 
 
 		 825 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.2 
 
 		 828 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  51.48 
 
 		 812 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  54.83 
 
 		 818 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  74.73 
 
 		 748 aa  1141    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  54.83 
 
 		 818 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  49.5 
 
 		 871 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  58.83 
 
 		 726 aa  803    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  49.93 
 
 		 852 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  60.27 
 
 		 722 aa  898    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  55.92 
 
 		 676 aa  727    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  61.62 
 
 		 734 aa  931    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  59.97 
 
 		 684 aa  809    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  83.64 
 
 		 752 aa  1261    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  52.15 
 
 		 822 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  58.39 
 
 		 712 aa  824    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  51.3 
 
 		 857 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  51.73 
 
 		 818 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  51.69 
 
 		 839 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  51.15 
 
 		 830 aa  639    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  53.46 
 
 		 812 aa  663    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  50.86 
 
 		 810 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.61 
 
 		 837 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.61 
 
 		 846 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  52.57 
 
 		 847 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  54.73 
 
 		 810 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  52.95 
 
 		 814 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  50.07 
 
 		 842 aa  663    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  50.14 
 
 		 843 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  53.85 
 
 		 816 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  50.52 
 
 		 855 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  50.6 
 
 		 859 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  51.51 
 
 		 812 aa  651    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  52.01 
 
 		 830 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.03 
 
 		 811 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  52.95 
 
 		 822 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  51.26 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  50.88 
 
 		 811 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  52.25 
 
 		 847 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  53.4 
 
 		 844 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  52.26 
 
 		 834 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  53.4 
 
 		 836 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.88 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.1 
 
 		 834 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  50.84 
 
 		 812 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.85 
 
 		 866 aa  631  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  53.4 
 
 		 844 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.22 
 
 		 851 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>