More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0889 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  53.1 
 
 
812 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  55.5 
 
 
791 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.45 
 
 
811 aa  662    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.48 
 
 
824 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  53.24 
 
 
812 aa  653    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  53.7 
 
 
849 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  50.51 
 
 
853 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  54.47 
 
 
817 aa  687    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  53.45 
 
 
844 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  50.69 
 
 
824 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  55.1 
 
 
818 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  58.62 
 
 
753 aa  837    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  55.83 
 
 
791 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  54.27 
 
 
813 aa  676    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  58.26 
 
 
734 aa  825    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  52.04 
 
 
822 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  54.11 
 
 
818 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  50.22 
 
 
871 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  52.07 
 
 
869 aa  663    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  52.26 
 
 
830 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  52.68 
 
 
855 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  54.73 
 
 
823 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  59.71 
 
 
816 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  55.49 
 
 
814 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  55.1 
 
 
818 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  49.86 
 
 
847 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  53.83 
 
 
843 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  57.42 
 
 
814 aa  678    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  53.65 
 
 
846 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  53.67 
 
 
830 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  53.43 
 
 
842 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  53.94 
 
 
824 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  53.12 
 
 
851 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.35 
 
 
840 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  51.99 
 
 
845 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  54.67 
 
 
834 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  53.29 
 
 
844 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  53.32 
 
 
840 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  56.94 
 
 
811 aa  666    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  53.5 
 
 
848 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  54.41 
 
 
822 aa  669    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  52.21 
 
 
890 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  52.9 
 
 
846 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  56.23 
 
 
822 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  50.72 
 
 
871 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  53.51 
 
 
792 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  53.3 
 
 
847 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  56.84 
 
 
837 aa  676    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  55.26 
 
 
824 aa  680    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  55.14 
 
 
834 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  52.57 
 
 
848 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.79 
 
 
814 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  53.2 
 
 
814 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  56.02 
 
 
814 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  54.73 
 
 
825 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  52.93 
 
 
825 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  51.99 
 
 
847 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  54.6 
 
 
828 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  53.45 
 
 
836 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  60.32 
 
 
748 aa  850    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.63 
 
 
823 aa  645    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  51.17 
 
 
859 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  57.27 
 
 
726 aa  739    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.31 
 
 
811 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  56.75 
 
 
722 aa  779    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  56.5 
 
 
821 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  55.16 
 
 
811 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  57.53 
 
 
684 aa  748    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  58.55 
 
 
752 aa  818    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  54.81 
 
 
849 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  53.17 
 
 
830 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  53.86 
 
 
857 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  54.32 
 
 
839 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  55 
 
 
834 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  52.37 
 
 
854 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  52.98 
 
 
824 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  53.27 
 
 
861 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  53.3 
 
 
847 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  52.83 
 
 
847 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  53.7 
 
 
860 aa  677    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  56.29 
 
 
811 aa  662    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  55.72 
 
 
812 aa  691    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  53.12 
 
 
842 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  53.74 
 
 
843 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  52.83 
 
 
855 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  51.6 
 
 
859 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  53.62 
 
 
848 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  50.66 
 
 
803 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  56.28 
 
 
818 aa  708    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  55.96 
 
 
823 aa  700    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  53.82 
 
 
792 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  53.3 
 
 
847 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  52.38 
 
 
789 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  53.2 
 
 
841 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  57.33 
 
 
812 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>