More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1329 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1329  AAA family ATPase  100 
 
 		 587 aa  1210    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000361614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2102  AAA ATPase central domain protein  47.03 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5083  AAA ATPase central domain protein  29.57 
 
 		 625 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322132  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3140  ATPase central domain-containing protein  28.12 
 
 		 617 aa  243  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2464  ATPase central domain-containing protein  29.1 
 
 		 616 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  26.44 
 
 		 567 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.03 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  26.86 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  28.15 
 
 		 488 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  27.91 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  27.41 
 
 		 515 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  27.13 
 
 		 537 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  29.23 
 
 		 492 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  27.27 
 
 		 488 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  29.23 
 
 		 492 aa  90.9  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  27.97 
 
 		 496 aa  90.5  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  28.82 
 
 		 492 aa  90.5  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  27.73 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  27.27 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  27.27 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  31.43 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  28.88 
 
 		 503 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  28.88 
 
 		 503 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  29.46 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  28.76 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  28.62 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  28.16 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.27 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.05 
 
 		 760 aa  85.1  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  29.18 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.17 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.94 
 
 		 737 aa  84  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.25 
 
 		 721 aa  84  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.05 
 
 		 759 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  30.19 
 
 		 804 aa  83.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.05 
 
 		 718 aa  83.2  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.24 
 
 		 731 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  30.53 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1124 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  27.98 
 
 		 832 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  30.19 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  28.26 
 
 		 788 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  33.33 
 
 		 829 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.02 
 
 		 768 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  29.76 
 
 		 713 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.86 
 
 		 719 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  28.57 
 
 		 883 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  29.38 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  30.37 
 
 		 1178 aa  80.5  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  28.91 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 810 aa  80.5  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  27.92 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  27.54 
 
 		 784 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  24.8 
 
 		 552 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  30 
 
 		 763 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  26.65 
 
 		 550 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.8 
 
 		 468 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.3 
 
 		 703 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.74 
 
 		 781 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.88 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  29.65 
 
 		 867 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  28.91 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.25 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  27.27 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.88 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.87 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.23 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.05 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  28.7 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.77 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  26.23 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83848  AAA ATPase, peroxisomal biogenesis  27.38 
 
 		 1053 aa  78.2  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  31.35 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.04 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.57 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.75 
 
 		 684 aa  78.2  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  29.25 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.04 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  26.92 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  26.72 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  29.31 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.44 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  29.53 
 
 		 729 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.57 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  25.23 
 
 		 1284 aa  77.8  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  30.16 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  26.76 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.05 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  26.23 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  27.84 
 
 		 637 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  28.63 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.95 
 
 		 735 aa  77.4  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.58 
 
 		 754 aa  77  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  27.84 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30 
 
 		 810 aa  77  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.18 
 
 		 736 aa  77  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 		 743 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>