More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83848 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_83848  AAA ATPase, peroxisomal biogenesis  100 
 
 
1053 aa  2156    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05991  peroxisome biogenesis protein peroxin 1 (Eurofung)  33.5 
 
 
1225 aa  597  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453589 
 
 
-
 
NC_006686  CND06230  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 
1076 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.91 
 
 
759 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.28 
 
 
718 aa  300  8e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.39 
 
 
760 aa  293  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.59 
 
 
738 aa  292  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.39 
 
 
727 aa  292  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.56 
 
 
754 aa  289  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.27 
 
 
754 aa  288  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.94 
 
 
804 aa  287  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.6 
 
 
719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.57 
 
 
732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.01 
 
 
736 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.26 
 
 
739 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.73 
 
 
757 aa  283  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.5 
 
 
731 aa  283  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.96 
 
 
768 aa  282  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.54 
 
 
754 aa  280  7e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.17 
 
 
769 aa  280  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.75 
 
 
737 aa  280  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.61 
 
 
721 aa  280  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.81 
 
 
735 aa  279  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.36 
 
 
737 aa  279  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.31 
 
 
810 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.65 
 
 
754 aa  278  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.14 
 
 
738 aa  278  4e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.53 
 
 
763 aa  277  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.24 
 
 
731 aa  277  7e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  33.39 
 
 
814 aa  277  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.73 
 
 
731 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.92 
 
 
731 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.01 
 
 
722 aa  275  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 
723 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  34.24 
 
 
754 aa  274  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  31.47 
 
 
775 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 
810 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.05 
 
 
715 aa  271  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  30.13 
 
 
703 aa  270  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  33.7 
 
 
703 aa  270  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.81 
 
 
806 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  35.44 
 
 
550 aa  268  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.14 
 
 
781 aa  266  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.26 
 
 
738 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.24 
 
 
742 aa  265  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  33.26 
 
 
699 aa  265  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  33.19 
 
 
713 aa  265  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.37 
 
 
740 aa  265  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  33.8 
 
 
718 aa  264  8.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  29.62 
 
 
806 aa  263  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.74 
 
 
808 aa  261  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.4 
 
 
709 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.32 
 
 
739 aa  260  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.98 
 
 
743 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  30.52 
 
 
829 aa  260  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.61 
 
 
701 aa  259  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.64 
 
 
704 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.41 
 
 
784 aa  258  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.47 
 
 
753 aa  258  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.46 
 
 
755 aa  257  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.4 
 
 
773 aa  257  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.87 
 
 
746 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.17 
 
 
742 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  31.22 
 
 
763 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  30.92 
 
 
764 aa  255  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  32.75 
 
 
685 aa  255  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.29 
 
 
781 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.8 
 
 
740 aa  253  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  31.19 
 
 
732 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.08 
 
 
736 aa  251  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.66 
 
 
852 aa  251  7e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.08 
 
 
772 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  31.57 
 
 
930 aa  248  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  31.36 
 
 
788 aa  248  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.94 
 
 
757 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.38 
 
 
800 aa  248  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  31.05 
 
 
691 aa  247  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.79 
 
 
757 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
801 aa  247  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  31.84 
 
 
601 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.16 
 
 
803 aa  243  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  31.48 
 
 
776 aa  243  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.29 
 
 
756 aa  243  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  32.54 
 
 
613 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  39.66 
 
 
1178 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.4 
 
 
805 aa  238  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  31.81 
 
 
647 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  32.1 
 
 
749 aa  237  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  39.3 
 
 
1476 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  31.03 
 
 
748 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  30.71 
 
 
747 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  30.25 
 
 
639 aa  232  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  30.55 
 
 
750 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  29.62 
 
 
826 aa  231  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.02 
 
 
805 aa  231  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  31.24 
 
 
734 aa  230  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.17 
 
 
810 aa  230  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  30.2 
 
 
721 aa  230  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36081  predicted protein  39.58 
 
 
366 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.32 
 
 
804 aa  227  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>