More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06230 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06230  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1076 aa  2201    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83848  AAA ATPase, peroxisomal biogenesis  42.53 
 
 
1053 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05991  peroxisome biogenesis protein peroxin 1 (Eurofung)  42.86 
 
 
1225 aa  477  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.55 
 
 
727 aa  293  9e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.05 
 
 
759 aa  293  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.45 
 
 
760 aa  292  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.85 
 
 
736 aa  292  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.48 
 
 
718 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.17 
 
 
769 aa  290  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.77 
 
 
732 aa  290  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.55 
 
 
737 aa  283  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.76 
 
 
737 aa  281  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.31 
 
 
735 aa  281  6e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38 
 
 
731 aa  281  6e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.85 
 
 
738 aa  280  7e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.22 
 
 
754 aa  279  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.27 
 
 
768 aa  278  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.11 
 
 
784 aa  277  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.34 
 
 
738 aa  277  8e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.37 
 
 
731 aa  277  9e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.39 
 
 
723 aa  275  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.16 
 
 
781 aa  275  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.37 
 
 
731 aa  275  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.79 
 
 
781 aa  273  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.53 
 
 
731 aa  273  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.72 
 
 
800 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  34.99 
 
 
722 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.06 
 
 
754 aa  270  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.78 
 
 
806 aa  268  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  37.35 
 
 
550 aa  268  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.99 
 
 
721 aa  268  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.15 
 
 
754 aa  267  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.45 
 
 
808 aa  266  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.23 
 
 
754 aa  265  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34 
 
 
763 aa  263  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  34.04 
 
 
703 aa  262  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.04 
 
 
757 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  34.31 
 
 
930 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.77 
 
 
719 aa  259  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.9 
 
 
852 aa  259  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.18 
 
 
754 aa  259  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
810 aa  258  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.12 
 
 
810 aa  257  7e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  35.34 
 
 
804 aa  257  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.92 
 
 
775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.66 
 
 
753 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.31 
 
 
739 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  33.39 
 
 
729 aa  255  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.4 
 
 
709 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.7 
 
 
736 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.27 
 
 
715 aa  253  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.6 
 
 
701 aa  251  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.69 
 
 
704 aa  250  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  33.96 
 
 
685 aa  250  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.52 
 
 
814 aa  247  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.55 
 
 
738 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.79 
 
 
742 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  34.04 
 
 
829 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  34.73 
 
 
739 aa  245  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  32.99 
 
 
732 aa  245  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
755 aa  244  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  33.53 
 
 
806 aa  244  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  34.93 
 
 
613 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.93 
 
 
740 aa  243  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  35.67 
 
 
788 aa  242  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
826 aa  241  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.3 
 
 
740 aa  241  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  34.1 
 
 
756 aa  240  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  34.51 
 
 
601 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  48.81 
 
 
691 aa  240  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.38 
 
 
743 aa  239  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.55 
 
 
757 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.05 
 
 
757 aa  237  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.52 
 
 
718 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  33.58 
 
 
746 aa  237  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.18 
 
 
713 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  29.67 
 
 
832 aa  236  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  33.2 
 
 
639 aa  236  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.75 
 
 
742 aa  235  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.74 
 
 
801 aa  234  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.19 
 
 
756 aa  232  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  31.59 
 
 
763 aa  231  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.13 
 
 
773 aa  231  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  33.27 
 
 
747 aa  230  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.82 
 
 
703 aa  229  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.39 
 
 
801 aa  229  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  34.65 
 
 
1178 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  31.17 
 
 
764 aa  228  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.8 
 
 
772 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.73 
 
 
803 aa  225  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.04 
 
 
804 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.42 
 
 
805 aa  224  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  33.69 
 
 
699 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  31.9 
 
 
1124 aa  222  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  33.4 
 
 
776 aa  222  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
810 aa  220  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  32.12 
 
 
552 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  33.27 
 
 
647 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36081  predicted protein  49.77 
 
 
366 aa  218  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  42.07 
 
 
748 aa  218  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>