More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3837 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 715 aa  1406    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  56.8 
 
 		 683 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  38.4 
 
 		 699 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  36.58 
 
 		 720 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  36.11 
 
 		 625 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  40.95 
 
 		 715 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  41.46 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 590 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.92 
 
 		 679 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.11 
 
 		 672 aa  197  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  35.67 
 
 		 682 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  31.81 
 
 		 704 aa  193  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  33.69 
 
 		 654 aa  193  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  34.36 
 
 		 656 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.73 
 
 		 602 aa  191  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.22 
 
 		 639 aa  190  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.22 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  35.55 
 
 		 753 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.04 
 
 		 781 aa  187  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  33.58 
 
 		 639 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 		 793 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.8 
 
 		 794 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.27 
 
 		 685 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 657 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  34.27 
 
 		 760 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  34.19 
 
 		 697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  36.66 
 
 		 627 aa  183  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.78 
 
 		 753 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.09 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 635 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 660 aa  182  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.54 
 
 		 666 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  35.92 
 
 		 659 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  33.33 
 
 		 784 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  33.9 
 
 		 783 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  33.9 
 
 		 783 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.24 
 
 		 643 aa  180  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 620 aa  180  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.45 
 
 		 671 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 662 aa  180  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.7 
 
 		 669 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.15 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.55 
 
 		 659 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  33.33 
 
 		 616 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.9 
 
 		 672 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.41 
 
 		 635 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.52 
 
 		 615 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.85 
 
 		 639 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  35.61 
 
 		 681 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.87 
 
 		 633 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  33.1 
 
 		 633 aa  178  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  31.49 
 
 		 658 aa  177  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  33.17 
 
 		 635 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.17 
 
 		 635 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.13 
 
 		 673 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 		 671 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  34.39 
 
 		 689 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.3 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  33.66 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.41 
 
 		 714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  33.33 
 
 		 617 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.17 
 
 		 696 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.53 
 
 		 651 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.55 
 
 		 647 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  31.39 
 
 		 614 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  33.25 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.64 
 
 		 626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.9 
 
 		 801 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.15 
 
 		 635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 666 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 666 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  31.43 
 
 		 617 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  32.53 
 
 		 627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.85 
 
 		 684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  31.97 
 
 		 613 aa  174  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  36.25 
 
 		 645 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.96 
 
 		 611 aa  174  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.64 
 
 		 659 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  33.01 
 
 		 633 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.45 
 
 		 617 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.71 
 
 		 599 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  31.28 
 
 		 646 aa  173  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  32.27 
 
 		 744 aa  173  9e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  31.88 
 
 		 615 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  32.84 
 
 		 917 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 		 621 aa  173  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  31.67 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.88 
 
 		 613 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  34.06 
 
 		 652 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.17 
 
 		 743 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  33.98 
 
 		 637 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  31.42 
 
 		 641 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.39 
 
 		 687 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>