More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1422 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  92.73 
 
 
715 aa  1230    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
715 aa  1399    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2041  hypothetical protein  85.02 
 
 
284 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  38.15 
 
 
699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 
590 aa  231  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  40.05 
 
 
720 aa  228  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 
627 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 
625 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  39.1 
 
 
683 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  41.46 
 
 
715 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  32.04 
 
 
697 aa  168  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  31.79 
 
 
619 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.67 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.24 
 
 
620 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.35 
 
 
643 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.48 
 
 
656 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.99 
 
 
760 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  29.96 
 
 
704 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.45 
 
 
673 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.2 
 
 
784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.19 
 
 
601 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.28 
 
 
781 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.3 
 
 
625 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.82 
 
 
638 aa  154  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.95 
 
 
601 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.61 
 
 
641 aa  154  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  31.75 
 
 
784 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  31.99 
 
 
783 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  31.99 
 
 
783 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 
642 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 
642 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.82 
 
 
640 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.81 
 
 
794 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.22 
 
 
611 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.24 
 
 
622 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.75 
 
 
643 aa  152  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.65 
 
 
639 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.47 
 
 
640 aa  151  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 
607 aa  151  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.48 
 
 
651 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  30.18 
 
 
630 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  30.71 
 
 
645 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.7 
 
 
793 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.15 
 
 
642 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.62 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.16 
 
 
743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  31.28 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.68 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.64 
 
 
610 aa  148  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.24 
 
 
704 aa  148  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.88 
 
 
617 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  31.09 
 
 
682 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.14 
 
 
638 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.94 
 
 
660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.15 
 
 
638 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.14 
 
 
640 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 
673 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 
673 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  32.19 
 
 
800 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.72 
 
 
645 aa  147  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  31.88 
 
 
640 aa  147  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  32.24 
 
 
694 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  29.87 
 
 
658 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 
616 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.1 
 
 
640 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.68 
 
 
640 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.14 
 
 
638 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  30.13 
 
 
614 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 
646 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.7 
 
 
608 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  31.57 
 
 
637 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.85 
 
 
669 aa  145  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.38 
 
 
662 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  35.87 
 
 
663 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 
617 aa  145  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.13 
 
 
798 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.92 
 
 
640 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.4 
 
 
657 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.93 
 
 
663 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  31.08 
 
 
782 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  31.34 
 
 
611 aa  144  5e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.11 
 
 
643 aa  144  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.13 
 
 
646 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.13 
 
 
646 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.15 
 
 
644 aa  144  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 
640 aa  143  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.22 
 
 
696 aa  143  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  29.61 
 
 
608 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.76 
 
 
599 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.68 
 
 
623 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.23 
 
 
635 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.83 
 
 
645 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.91 
 
 
621 aa  143  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  28.91 
 
 
613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.04 
 
 
631 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.68 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.53 
 
 
613 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>