More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1566 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
625 aa  1245    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  39.41 
 
 
627 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 
699 aa  275  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 
720 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  35.25 
 
 
697 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  33.13 
 
 
619 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  34.69 
 
 
704 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 
683 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  33.03 
 
 
590 aa  238  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  33.71 
 
 
715 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 
715 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 
715 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  31.32 
 
 
644 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  30.34 
 
 
613 aa  192  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
644 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
644 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
647 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  31.32 
 
 
644 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.63 
 
 
650 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  32.68 
 
 
694 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.32 
 
 
647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  31.21 
 
 
660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  31.54 
 
 
647 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  31.54 
 
 
647 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  31.54 
 
 
647 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  31.54 
 
 
647 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  31.54 
 
 
647 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  31.21 
 
 
658 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  31.4 
 
 
647 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  31.4 
 
 
644 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  31.1 
 
 
647 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.18 
 
 
654 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.98 
 
 
611 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  30.96 
 
 
643 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 
627 aa  189  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  30.99 
 
 
649 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  31.32 
 
 
644 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  31.18 
 
 
647 aa  188  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.85 
 
 
651 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  30.43 
 
 
651 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.32 
 
 
610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.64 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.33 
 
 
621 aa  186  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.65 
 
 
602 aa  183  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.33 
 
 
635 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  31.1 
 
 
660 aa  183  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  28.86 
 
 
611 aa  183  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.58 
 
 
651 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  31.51 
 
 
634 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.82 
 
 
632 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.15 
 
 
639 aa  183  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  31.28 
 
 
634 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.55 
 
 
659 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.02 
 
 
640 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.22 
 
 
697 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.89 
 
 
643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  29.56 
 
 
612 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.78 
 
 
651 aa  181  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.36 
 
 
637 aa  181  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.45 
 
 
682 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.93 
 
 
610 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  31.58 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  31.58 
 
 
642 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  32.54 
 
 
645 aa  180  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  31.21 
 
 
638 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  31 
 
 
641 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.81 
 
 
642 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.56 
 
 
662 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.16 
 
 
662 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.62 
 
 
673 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.69 
 
 
610 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.63 
 
 
650 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.62 
 
 
673 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.96 
 
 
630 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  32.36 
 
 
800 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.92 
 
 
673 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  30.51 
 
 
639 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  30.51 
 
 
639 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.89 
 
 
656 aa  178  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.24 
 
 
615 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 
635 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  30.91 
 
 
635 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.48 
 
 
647 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 
635 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.91 
 
 
660 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.25 
 
 
635 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.97 
 
 
642 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.97 
 
 
642 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 
644 aa  177  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.28 
 
 
628 aa  177  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  35.4 
 
 
646 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.86 
 
 
641 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 
616 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.58 
 
 
655 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.21 
 
 
657 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.61 
 
 
630 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  31.99 
 
 
693 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>