More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2720 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  65.18 
 
 
644 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.18 
 
 
647 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  60.81 
 
 
650 aa  729    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.35 
 
 
640 aa  813    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  56.5 
 
 
614 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.9 
 
 
637 aa  834    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.02 
 
 
651 aa  758    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  60.55 
 
 
638 aa  779    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.72 
 
 
627 aa  654    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  58.08 
 
 
628 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.34 
 
 
660 aa  784    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  55.45 
 
 
644 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  67.7 
 
 
649 aa  818    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  64.5 
 
 
634 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.25 
 
 
657 aa  821    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.31 
 
 
651 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  62.75 
 
 
639 aa  737    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  62.75 
 
 
639 aa  737    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  64.34 
 
 
634 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.13 
 
 
628 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  62.06 
 
 
626 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.02 
 
 
655 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.72 
 
 
621 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  58.23 
 
 
627 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.54 
 
 
641 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.33 
 
 
630 aa  698    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  59.69 
 
 
640 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  57.79 
 
 
639 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.66 
 
 
642 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  60.89 
 
 
641 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.29 
 
 
635 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.25 
 
 
657 aa  821    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  56.33 
 
 
616 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  65.18 
 
 
644 aa  798    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  58.98 
 
 
632 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.54 
 
 
652 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  56.98 
 
 
641 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  55.38 
 
 
649 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.04 
 
 
663 aa  838    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  55.94 
 
 
608 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.11 
 
 
645 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.36 
 
 
665 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.09 
 
 
651 aa  750    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  62.52 
 
 
651 aa  777    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.94 
 
 
657 aa  824    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
641 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.93 
 
 
631 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.9 
 
 
640 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.1 
 
 
655 aa  819    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  59.14 
 
 
628 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.74 
 
 
634 aa  827    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.11 
 
 
647 aa  816    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.76 
 
 
638 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.11 
 
 
644 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.02 
 
 
636 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  65.12 
 
 
642 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  58.59 
 
 
638 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.85 
 
 
639 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  100 
 
 
641 aa  1305    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.56 
 
 
638 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.78 
 
 
631 aa  743    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.66 
 
 
640 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  58.03 
 
 
629 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.22 
 
 
656 aa  824    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.08 
 
 
638 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.54 
 
 
655 aa  780    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.46 
 
 
638 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.97 
 
 
628 aa  653    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.79 
 
 
649 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.04 
 
 
627 aa  775    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.07 
 
 
659 aa  789    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.05 
 
 
640 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  64.81 
 
 
658 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.84 
 
 
627 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.77 
 
 
640 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  62.79 
 
 
644 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.15 
 
 
656 aa  770    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.31 
 
 
645 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  65.43 
 
 
650 aa  827    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  59.31 
 
 
628 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  61.14 
 
 
612 aa  760    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.42 
 
 
621 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.78 
 
 
656 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.35 
 
 
657 aa  824    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.35 
 
 
657 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  62.16 
 
 
639 aa  767    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.09 
 
 
657 aa  832    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  55.05 
 
 
764 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 
631 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  64.96 
 
 
639 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 
631 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.16 
 
 
652 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.8 
 
 
673 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  65.88 
 
 
657 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>