36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_10701 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  100 
 
 
198 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  90.4 
 
 
198 aa  346  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  72.45 
 
 
197 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10681  ATP/GTP-binding motif-containing protein  51.09 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  40 
 
 
204 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  37.06 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  26.46 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.18 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.88 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  25 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  24.07 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.44 
 
 
207 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  27.43 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  29.55 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  25 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.29 
 
 
504 aa  48.5  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  26.4 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  26.4 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.55 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  29.83 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  29.19 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  27.5 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  27.5 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  27.43 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  26.97 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  26.97 
 
 
232 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  24.14 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.43 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  24.22 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  23.03 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  23.43 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.63 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  25 
 
 
216 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  29.22 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  24 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3945  hypothetical protein  27.66 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>