17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3945 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3945  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2611  hypothetical protein  48.3 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4093  hypothetical protein  45.76 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0769  hypothetical protein  44 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4241  hypothetical protein  43.35 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.572798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2310  hypothetical protein  44.89 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352011  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1671  hypothetical protein  25.7 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2139  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  26.83 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4731  hypothetical protein  27.62 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0252  putative phosphotransferase  38.46 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9011  hypothetical protein  27.69 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1075  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  36.26 
 
 		 192 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.71 
 
 		 223 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0650  hypothetical protein  31.82 
 
 		 99 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.823268  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  27.66 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3948  nucleoside kinase, CMP and AMP kinase  32.5 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>