17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2611 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2611  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0769  hypothetical protein  71.68 
 
 
177 aa  267  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4093  hypothetical protein  69.49 
 
 
178 aa  262  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2310  hypothetical protein  74.58 
 
 
192 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352011  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4241  hypothetical protein  64.33 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.572798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3945  hypothetical protein  48.3 
 
 
176 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1671  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2139  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  31.5 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0633  Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase  31.85 
 
 
316 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0439631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9011  hypothetical protein  34.13 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  27.45 
 
 
508 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  24.6 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  23.53 
 
 
207 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 
623 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  24.06 
 
 
211 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
269 aa  41.2  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4796  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  31.93 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.989698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>