18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2310 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2310  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352011  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2611  hypothetical protein  75 
 
 		 178 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0769  hypothetical protein  72.25 
 
 		 177 aa  260  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4093  hypothetical protein  69.36 
 
 		 178 aa  254  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4241  hypothetical protein  61.4 
 
 		 177 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.572798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3945  hypothetical protein  44.89 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1671  hypothetical protein  24.14 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2139  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  30.71 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.203222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4796  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  31.78 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.989698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0633  Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase  28.93 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0439631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  27.92 
 
 		 428 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  33.73 
 
 		 333 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  32.93 
 
 		 259 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 328 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  28.68 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  32.35 
 
 		 336 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  41.51 
 
 		 688 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>