31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3531 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  46.91 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  47.42 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  49.49 
 
 		 354 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  48.99 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  48.13 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  45.73 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  43.56 
 
 		 223 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  38.89 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25.81 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  31.29 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  24.22 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  27.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  27.32 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  30.77 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.48 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  29.91 
 
 		 526 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  24.22 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  27.59 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  25.53 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.45 
 
 		 555 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  23.38 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  27.32 
 
 		 529 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  25.53 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  23.53 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3961  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.48 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.926817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  24.2 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  21.69 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  22.01 
 
 		 207 aa  42  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  22.92 
 
 		 242 aa  41.2  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.19 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>