92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3297 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  60.59 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  56.92 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  49.74 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  51 
 
 		 354 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  47.69 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  52.69 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  48.83 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  43.98 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.93 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.93 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  26.88 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  33.04 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  24.05 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.15 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.41 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  30.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  33.33 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  29.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  29.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  29.7 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  30.25 
 
 		 554 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  29.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  27.88 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  29.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  27.27 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.68 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  30.7 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  27.27 
 
 		 549 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  27.27 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  27.27 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  30.17 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  28.18 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  34.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  27.27 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.14 
 
 		 547 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.7 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  24.53 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  30.7 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  28.31 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.63 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  27.27 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.37 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.62 
 
 		 559 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.17 
 
 		 557 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.04 
 
 		 550 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  30.77 
 
 		 526 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  30.17 
 
 		 529 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  21.43 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.43 
 
 		 552 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  25.9 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.06 
 
 		 504 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25.16 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  26.62 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.88 
 
 		 462 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  26.83 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  33 
 
 		 553 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.71 
 
 		 555 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  24.79 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.92 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  24.52 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.99 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  28.32 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  25.42 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  27.85 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  24.89 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  24.89 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  22.11 
 
 		 553 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.27 
 
 		 567 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  27.61 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  25.4 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  25.4 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.07 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  25.15 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  26.49 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  27.93 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  24.18 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 594 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  23.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  31.03 
 
 		 557 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  28.83 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  25.9 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  25.4 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  25.18 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  26.71 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1173  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.87 
 
 		 325 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  24.76 
 
 		 215 aa  42  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  24.76 
 
 		 215 aa  42  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  25.15 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>