289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3179 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  67.46 
 
 		 152 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  68 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  55.04 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  48.84 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 398 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  50.81 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  43.41 
 
 		 399 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  45.22 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  45.22 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  40.91 
 
 		 354 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  37.17 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  38.95 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  37 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  40.43 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  46.03 
 
 		 318 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.03 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.03 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  38.3 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  49.09 
 
 		 302 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  31.82 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  51.72 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  34.91 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  30.83 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  30.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  38.33 
 
 		 321 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  27.18 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  25.98 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  33.58 
 
 		 315 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  45.76 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.49 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  30.56 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.79 
 
 		 316 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  40.98 
 
 		 524 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.79 
 
 		 316 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  35.4 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  45.76 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.3 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  43.08 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>