164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3019 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  47.55 
 
 		 399 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  47.29 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  49.19 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  47.1 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  44.2 
 
 		 354 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  49.18 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 		 398 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  39.42 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  40.62 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  36.57 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  34.45 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  36.61 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  30.17 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.29 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  52 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  43.1 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.64 
 
 		 316 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44.12 
 
 		 570 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 156 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0103  MutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  39.06 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  26 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 139 aa  42  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.84 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>