137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2432 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  279  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  59.38 
 
 
133 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
132 aa  167  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  47.97 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  51.82 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
134 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  44 
 
 
140 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  51.4 
 
 
138 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
130 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  36 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  34.82 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0577  hypothetical protein  56 
 
 
51 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  33.58 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.7 
 
 
399 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
398 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  29 
 
 
136 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  48.33 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  38.71 
 
 
354 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.09 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  25 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  31.78 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  36.54 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  31.78 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  40 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  34.44 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  31.25 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0103  MutT/nudix family protein  29.75 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  33.03 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.85 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  34.94 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  30 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  34.94 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.57 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  30 
 
 
132 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  50 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.42 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
150 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  35.94 
 
 
162 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  24.63 
 
 
149 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  35 
 
 
136 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  40 
 
 
169 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
153 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  27.08 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
303 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.24 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.24 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  33.73 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>