147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1157 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  62.86 
 
 
205 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 
176 aa  241  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
180 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  64.53 
 
 
173 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  63.37 
 
 
172 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  59.89 
 
 
178 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  63.84 
 
 
177 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  61.05 
 
 
172 aa  224  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  59.88 
 
 
172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  60.23 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  60.23 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  55.23 
 
 
186 aa  209  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
176 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  59.66 
 
 
176 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  56.5 
 
 
182 aa  205  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  55.31 
 
 
187 aa  204  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
175 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  38.31 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  37.66 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  29.59 
 
 
231 aa  51.6  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
237 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  40 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
303 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
155 aa  47.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  32.38 
 
 
158 aa  47.8  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  42.65 
 
 
146 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  43.75 
 
 
160 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
314 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
145 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 
148 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  34.78 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  29.68 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
149 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
322 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  45.45 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  45.45 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  45.45 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  43.9 
 
 
314 aa  44.7  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
173 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  40.82 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  43.48 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.07 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 
241 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  47.5 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  47.5 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  45.24 
 
 
325 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
336 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0502  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  39.58 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40 
 
 
299 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.35 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  45 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.53 
 
 
315 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 
131 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  47.37 
 
 
317 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 
131 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.86 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>