88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2946 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  78.41 
 
 		 173 aa  291  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  71.02 
 
 		 178 aa  264  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  65.91 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  63.64 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  61.36 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  63.07 
 
 		 172 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  61.93 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  58.92 
 
 		 180 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  60.22 
 
 		 176 aa  225  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  59.67 
 
 		 176 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  59.67 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  58.56 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  57.46 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  57.46 
 
 		 176 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  59.22 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 187 aa  209  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  53.98 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  37.58 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  36.91 
 
 		 171 aa  94.4  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  32.84 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  43.9 
 
 		 314 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.82 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  27.46 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 299 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.88 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 		 303 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 237 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.95 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.95 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 341 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 322 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  48.72 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.51 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 314 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.33 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.95 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  28.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 		 175 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 137 aa  42  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 156 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2328  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.8 
 
 		 173 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  34.78 
 
 		 149 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 351 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.39 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 		 336 aa  40.8  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1038  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.99 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  41.03 
 
 		 343 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0834  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.33 
 
 		 239 aa  40.8  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.496439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  31.3 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 315 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.58 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>