294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0263 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  100 
 
 
164 aa  330  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  88.75 
 
 
173 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  88.75 
 
 
169 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  81.65 
 
 
178 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  71.15 
 
 
173 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 
167 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2284  NUDIX hydrolase  54.04 
 
 
195 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151549  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2559  NUDIX hydrolase  53.05 
 
 
195 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599331  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 
202 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.7 
 
 
175 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50.31 
 
 
172 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
167 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.41 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  48.77 
 
 
179 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.69 
 
 
164 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
165 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.47 
 
 
167 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0564  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.53 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.68 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4225  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 
186 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  0.0214287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.58 
 
 
174 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.58 
 
 
177 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.86 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.06 
 
 
168 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.86 
 
 
178 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.96 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0166  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.25 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0260  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.39 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.48 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.38 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1470  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.25 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.03 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.65 
 
 
170 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4735  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000037989  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.8 
 
 
162 aa  125  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
160 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.03 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.03 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  46.25 
 
 
168 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
161 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.77 
 
 
163 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.75 
 
 
187 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.14 
 
 
172 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0556  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000501582  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.046247  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2797  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
215 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0104  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0514  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.561307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2647  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0489  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0586  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0927743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0440  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3521  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3483  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3264  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2518  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3519  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.220968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3444  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
246 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00155901  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1299  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0910715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.99 
 
 
183 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0512  putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
249 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.46 
 
 
171 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.88 
 
 
162 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.55 
 
 
176 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.13 
 
 
199 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2817  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
238 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0131722  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
158 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0645  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.51 
 
 
182 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000308205  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.12 
 
 
172 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.12 
 
 
199 aa  104  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.75 
 
 
235 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
153 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
175 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.12 
 
 
197 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2652  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.39 
 
 
235 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.72 
 
 
175 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3062  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.39 
 
 
235 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.8 
 
 
197 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00110033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
175 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
175 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.13 
 
 
226 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.89 
 
 
203 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0834  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.37 
 
 
239 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.496439  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  36.53 
 
 
173 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.53 
 
 
172 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.93 
 
 
170 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.93 
 
 
193 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>