49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0536 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  62.35 
 
 		 172 aa  244  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  61.63 
 
 		 172 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  58.14 
 
 		 172 aa  234  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  60.47 
 
 		 205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  55.23 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  56.4 
 
 		 173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  55.23 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  53.98 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  56.79 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  53.41 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 187 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  55.35 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 180 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  53.37 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 		 175 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  32.69 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  32.05 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  25.2 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  27.48 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  47.62 
 
 		 325 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  25.81 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.77 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 		 322 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.51 
 
 		 314 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.51 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 140 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 156 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  28.85 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 314 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 341 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>