132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2646 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  84.83 
 
 		 145 aa  247  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  84.14 
 
 		 145 aa  246  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 146 aa  166  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  57.24 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  28.79 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  27.94 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  27.21 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  32.28 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3072  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  26.39 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  27.61 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  27.42 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  26.52 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2779  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  29.32 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  26.52 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 311 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 311 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 311 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  46.43 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  29.6 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3089  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  28.24 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  39.51 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  32.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  29.46 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 188 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0843  NUDIX family hydrolase  32.86 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3056  mutT/nudix family protein  27.59 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  32.87 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 281 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  29.76 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 299 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.13 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 216 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  29.13 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2899  MutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 291 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 179 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.37 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>