23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0683 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0683  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  277  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0649  MutT/nudix family protein  73.88 
 
 		 136 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003515  hypothetical protein  46.97 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.430687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02247  hypothetical protein  44.36 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0501  NUDIX hydrolase  48.6 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  29.6 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  29.6 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  29.6 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  29.6 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  28.8 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  28.8 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  28 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  28 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1558  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  44.44 
 
 		 204 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.8 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 162 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>