16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003515 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003515  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  285  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.430687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02247  hypothetical protein  67.41 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0683  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
134 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0649  MutT/nudix family protein  44.44 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0501  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  31.97 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  33.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
148 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
146 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>